39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2506 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2506  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  100 
 
 		 130 aa  263  5.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0566  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  87.69 
 
 		 130 aa  235  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0032  hypothetical protein  41.94 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  29.31 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4574  hypothetical protein  30.89 
 
 		 417 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.284031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4772  hypothetical protein  29.6 
 
 		 645 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021908 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5199  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.18 
 
 		 471 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6615  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.69 
 
 		 561 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2027  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.64 
 
 		 522 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000415443  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3702  hypothetical protein  30.4 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5433  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.55 
 
 		 231 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4396  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  30.4 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1138  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.21 
 
 		 442 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4524  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.98 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4606  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  34.48 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0299276  normal  0.248208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0736  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  28.57 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1096  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25 
 
 		 467 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  28.8 
 
 		 200 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  28.8 
 
 		 200 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1826  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.27 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  21.26 
 
 		 390 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1895  hypothetical protein  24.3 
 
 		 198 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138614  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7408  hypothetical protein  23.97 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3229  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25 
 
 		 482 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3014  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25 
 
 		 482 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1868  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25 
 
 		 482 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0224  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  25 
 
 		 482 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1546  ORF-3 family protein  27.62 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0403553 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0270  hypothetical protein  23.97 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1473  hypothetical protein  23.97 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0966536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3332  hypothetical protein  23.97 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7311  hypothetical protein  23.97 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7710  hypothetical protein  23.97 
 
 		 219 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.32 
 
 		 197 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6856  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  27.78 
 
 		 198 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424573  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4094  hypothetical protein  32 
 
 		 180 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1348  hypothetical protein  27.19 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.244032  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0009  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  24.14 
 
 		 472 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5956  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0211287  normal  0.0139937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>