More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1653 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 229 aa  470  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  92.14 
 
 		 229 aa  437  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  72.81 
 
 		 270 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  72.81 
 
 		 270 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  72.81 
 
 		 248 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  72.37 
 
 		 270 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  72.81 
 
 		 248 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  72.37 
 
 		 270 aa  354  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  71.49 
 
 		 248 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  71.05 
 
 		 248 aa  351  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  71.93 
 
 		 249 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  71.93 
 
 		 249 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  71.93 
 
 		 249 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  71.93 
 
 		 249 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  71.93 
 
 		 249 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  71.93 
 
 		 249 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  71.93 
 
 		 249 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  71.93 
 
 		 250 aa  349  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  71.05 
 
 		 436 aa  348  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  70.61 
 
 		 248 aa  347  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  68.86 
 
 		 248 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  69.3 
 
 		 249 aa  340  1e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  69.3 
 
 		 248 aa  337  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  68.86 
 
 		 247 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  69.3 
 
 		 293 aa  335  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 		 247 aa  335  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  68.42 
 
 		 247 aa  335  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  68.86 
 
 		 247 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  67.98 
 
 		 247 aa  333  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  66.67 
 
 		 247 aa  332  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 		 251 aa  332  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  67.11 
 
 		 247 aa  330  8e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 		 251 aa  329  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  68.42 
 
 		 247 aa  329  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  64.91 
 
 		 247 aa  329  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 		 251 aa  329  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 		 267 aa  329  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  64.47 
 
 		 249 aa  328  4e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  67.54 
 
 		 251 aa  327  8e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  65.35 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  64.47 
 
 		 247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  66.23 
 
 		 250 aa  324  7e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  66.67 
 
 		 247 aa  324  8.000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  62.28 
 
 		 248 aa  320  8e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  64.91 
 
 		 247 aa  319  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  63.32 
 
 		 234 aa  315  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  64.04 
 
 		 247 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  61.84 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  61.84 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  61.84 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  61.84 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  61.84 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  61.84 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  61.84 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  61.84 
 
 		 250 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  61.4 
 
 		 250 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  61.4 
 
 		 250 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  61.4 
 
 		 250 aa  312  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  63.6 
 
 		 249 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  61.4 
 
 		 250 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  60.96 
 
 		 250 aa  311  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  60.96 
 
 		 250 aa  311  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  63.16 
 
 		 247 aa  310  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2520  phosphoglyceromutase  63.16 
 
 		 245 aa  309  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000915293  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  64.91 
 
 		 245 aa  309  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  62.01 
 
 		 240 aa  308  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2583  phosphoglyceromutase  63.16 
 
 		 245 aa  307  8e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000223662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  63.16 
 
 		 247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2442  phosphoglyceromutase  61.84 
 
 		 245 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.205182  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  60.09 
 
 		 250 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  61.84 
 
 		 245 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  61.14 
 
 		 234 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2281  phosphoglyceromutase  62.72 
 
 		 245 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000568888  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  62.72 
 
 		 249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  60.53 
 
 		 250 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2234  phosphoglyceromutase  62.72 
 
 		 245 aa  304  7e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  60.53 
 
 		 250 aa  304  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  60.53 
 
 		 250 aa  303  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  60.09 
 
 		 250 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  60.09 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  60.53 
 
 		 248 aa  302  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2893  phosphoglyceromutase  61.84 
 
 		 245 aa  302  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00820625  normal  0.311861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  61.14 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  58.77 
 
 		 250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  58.77 
 
 		 250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  58.77 
 
 		 250 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2313  phosphoglyceromutase  62.28 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.479703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2509  phosphoglyceromutase  62.28 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.805366 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2488  phosphoglyceromutase  62.28 
 
 		 245 aa  300  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  61.06 
 
 		 229 aa  299  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  59.21 
 
 		 248 aa  295  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  60.44 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  59.21 
 
 		 248 aa  287  8e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  60.09 
 
 		 248 aa  287  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  61.4 
 
 		 232 aa  287  9e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  60.62 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  57.46 
 
 		 253 aa  285  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  60.09 
 
 		 230 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1395  phosphoglycerate mutase 1  56.89 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0143791  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0773  phosphoglycerate mutase 1 family  57.46 
 
 		 252 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.9005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>