38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4308 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4308  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00337964  normal  0.132689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0470  hypothetical protein  61.29 
 
 		 125 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4707  hypothetical protein  41.32 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1535  hypothetical protein  40.31 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.823036 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1245  hypothetical protein  42.06 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0057  hypothetical protein  36.36 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000330788  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0025  hypothetical protein  35.54 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.292513  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1231  hypothetical protein  36.72 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0922  hypothetical protein  35.71 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0400088  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1844  protein of unknown function DUF1044  47.5 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3645  hypothetical protein  37.9 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.801747  hitchhiker  0.0000000000510649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00073  hypothetical protein  52 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0639  protein of unknown function DUF1044  32.5 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12836  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2626  hypothetical protein  37.82 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0793  hypothetical protein  41.24 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4183  hypothetical protein  35.71 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1817  hypothetical protein  38.52 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000610999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3429  hypothetical protein  42.5 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0762  hypothetical protein  32.23 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0861  hypothetical protein  43.59 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2808  hypothetical protein  43.59 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0894  hypothetical protein  43.59 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.383433  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0165  protein of unknown function DUF1044  40.51 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1618  hypothetical protein  34.92 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2086  hypothetical protein  35.58 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.984543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0987  hypothetical protein  41.89 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.469409 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0155  hypothetical protein  38.52 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.77632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5090  hypothetical protein  36.43 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0267211 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0851  hypothetical protein  28.91 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152374  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4311  protein of unknown function DUF1044  31.45 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0427223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1502  hypothetical protein  34.62 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1781  protein of unknown function DUF1044  34.62 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4026  hypothetical protein  36.15 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686403 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2545  protein of unknown function DUF1044  31.86 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0053a  hypothetical protein  34.94 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0293608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1812  hypothetical protein  38 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0124  hypothetical protein  31.01 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3695  protein of unknown function DUF1044  33.08 
 
 		 119 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>