28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0057 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0057  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  644    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  28.87 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  22.15 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  28.52 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  27.81 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  26.04 
 
 		 1036 aa  67  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  28.35 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1096  S-layer domain-containing protein  28.86 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000091055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1024  S-layer domain-containing protein  28.86 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117034  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  25 
 
 		 932 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  42.11 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  27.14 
 
 		 255 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  27.64 
 
 		 946 aa  53.5  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  24.5 
 
 		 468 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  30.56 
 
 		 784 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0219  S-layer domain-containing protein  24.24 
 
 		 404 aa  50.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0217  S-layer domain-containing protein  24.24 
 
 		 404 aa  50.4  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  25.4 
 
 		 694 aa  49.7  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  28.74 
 
 		 416 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0789  S-layer protein sap precursor  39.71 
 
 		 814 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200088  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0885  s-layer protein sap  38.24 
 
 		 814 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0841  S-layer protein Sap  38.24 
 
 		 814 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822684  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  41.18 
 
 		 807 aa  45.4  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  27.84 
 
 		 186 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  36.84 
 
 		 575 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  25 
 
 		 919 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  28.82 
 
 		 408 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  38.24 
 
 		 822 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>