29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0052 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0052  uridine kinase-like  100 
 
 
193 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2184  phosphoribulokinase/uridine kinase  57.14 
 
 
233 aa  212  3e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1431  phosphoribulokinase/uridine kinase  57.71 
 
 
219 aa  200  1e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0330  uridine kinase-like  54.01 
 
 
240 aa  198  4e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0269818 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0173  uridine kinase-like protein  56.57 
 
 
219 aa  193  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0659  phosphoribulokinase/uridine kinase  51.69 
 
 
237 aa  187  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0202  uridine kinase  27.43 
 
 
204 aa  52.8  3e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81319  uridine kinase  25.58 
 
 
504 aa  49.7  3e-05  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0146953  normal  0.484619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0533  uridine kinase  24.32 
 
 
207 aa  49.3  4e-05  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0339  uridine kinase  29.29 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1702  uridine kinase  25.15 
 
 
207 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.69825  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1175  uridine kinase  25.15 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00730  uridine kinase  24.32 
 
 
207 aa  46.6  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0558456  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1668  uridine kinase  25.15 
 
 
207 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1215  uridine kinase  27.13 
 
 
218 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.75656e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  30.77 
 
 
636 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0178  phosphoribulokinase/uridine kinase  21.26 
 
 
555 aa  43.9  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.871097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0176  phosphoribulokinase/uridine kinase  21.26 
 
 
555 aa  43.9  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0833476  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0478  hypothetical protein  23.13 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0464  hypothetical protein  23.13 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1330  uridine kinase  26.37 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.60785 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1881  pantothenate kinase  28.79 
 
 
229 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1825  uridine kinase  25.66 
 
 
206 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0167  phosphoribulokinase  25.54 
 
 
322 aa  42.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0318519  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1407  DEAD/DEAH box helicase-like  29.06 
 
 
624 aa  41.6  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.721389  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0134  phosphoribulokinase/uridine kinase  27.05 
 
 
558 aa  42  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3563  uridine kinase  23.76 
 
 
213 aa  42  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.933791  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl306  uridine kinase  25 
 
 
208 aa  41.6  0.007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.66982e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0995  uridine kinase  22.12 
 
 
197 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0443185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>