More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4014 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4014  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 
312 aa  634    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.96 
 
 
325 aa  332  4e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  52.24 
 
 
323 aa  332  4e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  51.28 
 
 
347 aa  328  6e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  49.2 
 
 
327 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  49.84 
 
 
314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.34 
 
 
313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.88 
 
 
319 aa  318  5e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.15 
 
 
325 aa  315  7e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  49.17 
 
 
312 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  49.67 
 
 
305 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  49.34 
 
 
305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.48 
 
 
354 aa  311  6.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
318 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.74 
 
 
302 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25030  MoxR-like ATPase  49.03 
 
 
359 aa  308  9e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.958569  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0587  ATPase  55.31 
 
 
316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.131658  normal  0.0120598 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  50.16 
 
 
320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  50.5 
 
 
319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  50.16 
 
 
320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  52.2 
 
 
320 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  51.35 
 
 
320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  51.35 
 
 
320 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  51.35 
 
 
320 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.46 
 
 
313 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.42 
 
 
341 aa  305  6e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  51.01 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  47.57 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  50.16 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.99 
 
 
306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  53.07 
 
 
302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3209  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00106546  normal  0.0189489 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2560  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 
315 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.050472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.66 
 
 
314 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  48.72 
 
 
310 aa  300  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.99 
 
 
306 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.99 
 
 
306 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.71 
 
 
322 aa  298  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2205  hypothetical protein  51.35 
 
 
320 aa  298  8e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277828  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0049  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.08 
 
 
319 aa  298  9e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  51.07 
 
 
302 aa  296  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1183  ATPase  47.56 
 
 
309 aa  296  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.247758  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  47.54 
 
 
318 aa  296  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.49 
 
 
309 aa  295  6e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.59 
 
 
330 aa  295  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  50.17 
 
 
328 aa  294  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2860  methanol dehydrogenase regulatory protein  50.81 
 
 
325 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692572  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.13 
 
 
321 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3073  ATPase  48.88 
 
 
324 aa  293  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.205207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  45.21 
 
 
309 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  50 
 
 
308 aa  290  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  45.69 
 
 
310 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  48.92 
 
 
310 aa  290  3e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  50 
 
 
296 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  50 
 
 
296 aa  289  4e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  44.92 
 
 
310 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  44.92 
 
 
310 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1586  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.76 
 
 
332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.766852 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  44.88 
 
 
310 aa  288  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3458  ATPase  51.66 
 
 
350 aa  288  6e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  50 
 
 
342 aa  288  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0253  ATPase  48.41 
 
 
329 aa  288  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  47.63 
 
 
319 aa  288  9e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  48.5 
 
 
313 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  46.67 
 
 
309 aa  286  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.4 
 
 
337 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.528453  normal  0.396618 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.67 
 
 
310 aa  285  5.999999999999999e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  44.26 
 
 
310 aa  285  7e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3232  ATPase  50.9 
 
 
350 aa  285  7e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0360468 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  43.93 
 
 
310 aa  285  8e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  43.93 
 
 
310 aa  285  8e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.31 
 
 
316 aa  285  9e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  46.03 
 
 
309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  44.77 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1651  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.18 
 
 
356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.12 
 
 
305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  46 
 
 
309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  45.67 
 
 
309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  46 
 
 
309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3366  ATPase  45.25 
 
 
316 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1802  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.82 
 
 
321 aa  282  5.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.916735 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  46 
 
 
309 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  46 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  45.67 
 
 
309 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  45.67 
 
 
309 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3487  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.22 
 
 
324 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  45.33 
 
 
309 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.93 
 
 
324 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0180  ATPase  48.83 
 
 
320 aa  279  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0627815  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3925  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.15 
 
 
336 aa  279  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1274  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.55 
 
 
351 aa  279  5e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.150646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1210  ATPase  45.78 
 
 
372 aa  278  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215297  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0415  ATPase  48.77 
 
 
302 aa  278  9e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0958  MoxR-like ATPase  48.73 
 
 
457 aa  278  1e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  45.33 
 
 
309 aa  277  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  47.67 
 
 
325 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05630  MoxR-like ATPase  47.35 
 
 
331 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.609898  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1196  ATPase  51.05 
 
 
302 aa  277  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.160899  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.4 
 
 
318 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  47 
 
 
317 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>