More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3733 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0808  leucyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
860 aa  641  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0751  leucyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
860 aa  639  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
863 aa  641  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0990  leucyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
858 aa  644  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.300602  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
971 aa  825  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
806 aa  695  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 
802 aa  892  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
874 aa  645  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
810 aa  667  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
949 aa  818  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  52.55 
 
 
879 aa  746  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
824 aa  644  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0478  leucyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
894 aa  654  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
813 aa  637  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
954 aa  761  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01672  leucyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
867 aa  670  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
859 aa  645  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0691  leucyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
860 aa  640  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.229457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 
954 aa  847  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1098  leucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
859 aa  642  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.77445e-09 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  48.95 
 
 
899 aa  855  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 
802 aa  896  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
971 aa  825  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
864 aa  649  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 
816 aa  805  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3454  leucyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
814 aa  654  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
830 aa  660  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.31776e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
859 aa  647  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
817 aa  670  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 
833 aa  903  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
859 aa  655  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
968 aa  823  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
856 aa  662  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
840 aa  819  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 
854 aa  647  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
802 aa  891  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
802 aa  894  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
858 aa  678  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
829 aa  649  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 
864 aa  655  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
808 aa  840  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
826 aa  639  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
952 aa  833  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
865 aa  653  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
1016 aa  807  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 
868 aa  636  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1207  leucyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
860 aa  651  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.338789  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
857 aa  784  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
835 aa  823  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
857 aa  916  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 
814 aa  672  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
859 aa  645  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  5.16313e-07 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
816 aa  648  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 
802 aa  884  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3015  leucyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
860 aa  641  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652989  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1842  leucyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
860 aa  641  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
824 aa  662  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
828 aa  646  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
807 aa  766  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  40 
 
 
874 aa  645  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
862 aa  659  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
904 aa  695  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  8.64885e-05 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
805 aa  776  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
805 aa  854  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
823 aa  669  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
969 aa  815  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
904 aa  692  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 
806 aa  811  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  2.79205e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0705  leucyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
860 aa  640  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0764  leucyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 
860 aa  640  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  48.72 
 
 
805 aa  854  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
807 aa  802  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  46.54 
 
 
806 aa  796  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
819 aa  644  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2926  leucyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
860 aa  642  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.454668  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
987 aa  781  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 
802 aa  898  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
923 aa  827  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
874 aa  649  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
806 aa  834  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
804 aa  684  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
824 aa  655  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
854 aa  843  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
872 aa  660  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1009  leucyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
816 aa  679  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
990 aa  776  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_182  leucyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
813 aa  644  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00206077  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  42.81 
 
 
994 aa  766  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
949 aa  801  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
963 aa  839  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1074  leucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
875 aa  657  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.902773 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 
978 aa  788  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
819 aa  661  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0736  leucyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
865 aa  641  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
802 aa  894  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
951 aa  800  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004217  leucyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
857 aa  653  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.07673e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
984 aa  812  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
805 aa  777  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 
805 aa  818  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>