25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0057 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0057  entericidin EcnAB  100 
 
 		 71 aa  144  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0898  entericidin EcnAB  49.09 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1920  entericidin EcnAB  50 
 
 		 41 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5477  entericidin EcnAB  61.11 
 
 		 44 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525479  normal  0.114102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4708  entericidin EcnAB  61.11 
 
 		 44 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1994  entericidin EcnAB  51.28 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3561  entericidin EcnAB  61.11 
 
 		 44 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.878172  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4186  entericidin EcnAB  61.11 
 
 		 44 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4806  entericidin EcnAB  61.11 
 
 		 44 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3119  entericidin EcnAB  53.33 
 
 		 47 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3927  entericidin EcnAB  39.39 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5236  entericidin EcnAB  56.1 
 
 		 41 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.539123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1455  hypothetical protein  48.21 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1170  entericidin EcnAB  44.44 
 
 		 44 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402902  normal  0.0500316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0769  Entericidin EcnAB  47.62 
 
 		 42 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.495198  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2661  Entericidin EcnAB  52 
 
 		 44 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.440397 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0290  entericidin precursor lipoprotein  50 
 
 		 46 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3799  entericidin EcnAB  58.33 
 
 		 44 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120738 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2234  lipoprotein transmembrane  53.66 
 
 		 44 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.30503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2002  entericidin EcnAB  56.1 
 
 		 43 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.764034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2631  entericidin EcnAB  52.38 
 
 		 44 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0239  Entericidin EcnAB  46.51 
 
 		 45 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0143  Entericidin EcnAB  51.11 
 
 		 46 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0151  Entericidin EcnAB  48.89 
 
 		 46 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03154  lipoprotein transmembrane  48.89 
 
 		 46 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.801084  normal  0.170965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>