More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1061 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0021  phosphomannomutase  80.84 
 
 
429 aa  737    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0431995  normal  0.0965198 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0025  phosphomannomutase  77.52 
 
 
428 aa  715    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1061  phosphomannomutase  100 
 
 
429 aa  873    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2157  phosphomannomutase  76.64 
 
 
428 aa  707    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  35 
 
 
450 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  35.08 
 
 
881 aa  219  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  34.3 
 
 
464 aa  216  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  34.16 
 
 
462 aa  216  9e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  33.56 
 
 
456 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  33.56 
 
 
462 aa  213  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  35.2 
 
 
488 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  32.57 
 
 
456 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  33.78 
 
 
468 aa  210  4e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  32.57 
 
 
456 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  33.79 
 
 
465 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  31.92 
 
 
457 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  32.35 
 
 
456 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  33.33 
 
 
465 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  33.18 
 
 
458 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  34.67 
 
 
868 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  32.81 
 
 
461 aa  206  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  34.1 
 
 
830 aa  206  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  30.86 
 
 
446 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  32.29 
 
 
469 aa  205  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  33.03 
 
 
463 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  33.86 
 
 
464 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0032  phosphomannomutase  31.19 
 
 
439 aa  204  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.457022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  33.26 
 
 
466 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  33.71 
 
 
453 aa  203  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  32.58 
 
 
462 aa  203  6e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  32.67 
 
 
469 aa  203  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  32.22 
 
 
450 aa  202  8e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  33.03 
 
 
466 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  34 
 
 
854 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  33.04 
 
 
453 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  33.48 
 
 
472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  30.27 
 
 
475 aa  199  7e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  31.61 
 
 
472 aa  199  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  33.63 
 
 
465 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  33.64 
 
 
469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0122  Phosphomannomutase  33.56 
 
 
469 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  32.89 
 
 
461 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  34.45 
 
 
467 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  34.09 
 
 
471 aa  197  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  33.18 
 
 
457 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  34.09 
 
 
471 aa  196  6e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  33.63 
 
 
782 aa  196  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  34.52 
 
 
863 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.87 
 
 
463 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  32.66 
 
 
455 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  30.98 
 
 
461 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  34.68 
 
 
782 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  31.53 
 
 
448 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  32.5 
 
 
466 aa  194  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_002978  WD0695  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.84 
 
 
462 aa  194  3e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  31.22 
 
 
472 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0623  phosphomannomutase  33.11 
 
 
452 aa  194  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  31.9 
 
 
451 aa  192  8e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  30.6 
 
 
454 aa  192  9e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  32.95 
 
 
451 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  31.82 
 
 
461 aa  191  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  31.08 
 
 
452 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0045  phosphomannomutase  32.81 
 
 
467 aa  190  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109324  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2822  phosphomannomutase  30.56 
 
 
486 aa  190  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  31.28 
 
 
447 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  30.68 
 
 
456 aa  189  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0206  phosphomannomutase  29 
 
 
437 aa  189  9e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323905  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1301  phosphomannomutase  29.4 
 
 
437 aa  189  9e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  32.71 
 
 
465 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0617  phosphomannomutase  30.09 
 
 
437 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  32.65 
 
 
465 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  30.15 
 
 
475 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  30.14 
 
 
448 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0682  phosphomannomutase  30.23 
 
 
437 aa  186  6e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  29.37 
 
 
450 aa  186  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  31.65 
 
 
460 aa  186  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  31.63 
 
 
460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  30.43 
 
 
461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  29.15 
 
 
450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  32.31 
 
 
450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  30.53 
 
 
455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  31.22 
 
 
447 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2999  phosphomannomutase  30.79 
 
 
475 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  31.54 
 
 
447 aa  184  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  32.22 
 
 
450 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  32.29 
 
 
460 aa  183  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  31.89 
 
 
454 aa  183  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  30 
 
 
461 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  31.38 
 
 
457 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  31.45 
 
 
450 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  31.83 
 
 
469 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  30.68 
 
 
462 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  30.45 
 
 
462 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  30.56 
 
 
462 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1738  phosphomannomutase  28.45 
 
 
462 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0922588  hitchhiker  0.000796464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1632  phosphomannomutase  28.45 
 
 
462 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  31.03 
 
 
456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  32.27 
 
 
450 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2497  phosphomannomutase  30.13 
 
 
485 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679752  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1525  phosphomannomutase  28.45 
 
 
462 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>