109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2788 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2788  manganese containing catalase  100 
 
 
291 aa  594  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5095  catalase  83.56 
 
 
293 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47080  Mn-containing catalase  76.31 
 
 
291 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0318  non-heme catalase KatN  77.7 
 
 
294 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2044  Catalase  77.35 
 
 
290 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000198818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1436  catalase  73.33 
 
 
293 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3129  catalase  71.78 
 
 
290 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.147017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4409  catalase  69.58 
 
 
303 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1348  DNA mismatch endonuclease  68.37 
 
 
298 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3122  Mn-containing catalase  68.37 
 
 
298 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2997  Mn-containing catalase  68.37 
 
 
314 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4798  catalase  69.12 
 
 
300 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.137059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1415  catalase  68.99 
 
 
292 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.449813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1858  catalase  68.99 
 
 
292 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.724494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1921  catalase  68.99 
 
 
292 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0512858  hitchhiker  0.000184673 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1863  catalase  68.99 
 
 
292 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.958813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1597  catalase  68.99 
 
 
292 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.577365 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1645  catalase  66.89 
 
 
296 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5520  catalase  67.94 
 
 
308 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.807876 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5251  catalase  66.33 
 
 
301 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6729  catalase  66.2 
 
 
301 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1578  catalase  66.2 
 
 
304 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6253  catalase  66.2 
 
 
304 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3293  Catalase  51.53 
 
 
326 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2921  Catalase  49.44 
 
 
324 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5037  Catalase  47.6 
 
 
310 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2489  non-heme manganese-containing catalase  48.04 
 
 
421 aa  231  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1329  Catalase  44.31 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.714734  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1673  catalase  46.09 
 
 
277 aa  191  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.849273  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0376  manganese containing catalase  38.52 
 
 
249 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1620  manganese containing catalase  37.96 
 
 
230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2781  manganese containing catalase  37.45 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3821  manganese containing catalase  37.86 
 
 
230 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00457633  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3384  catalase  36.63 
 
 
231 aa  145  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000494245  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0288  manganese containing catalase  37.76 
 
 
245 aa  145  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1864  Catalase  40.98 
 
 
224 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.299932  normal  0.0213876 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03960  Catalase  42.63 
 
 
227 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00363943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1780  Catalase  41.33 
 
 
205 aa  142  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0656  manganese containing catalase  38.78 
 
 
189 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.807783  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4479  cotJC protein  38.78 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.163427 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2165  Catalase  39.8 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.114172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0895  cotJC protein  38.78 
 
 
189 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000660321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0414  manganese containing catalase  38.27 
 
 
203 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1392  manganese containing catalase  37.44 
 
 
190 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0766  cotJC protein  38.78 
 
 
189 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000213334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0714  cotJC protein  38.78 
 
 
189 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000298472  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0701  spore coat-associated protein JC  38.78 
 
 
189 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000246142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0803  spore coat-associated protein JC  38.78 
 
 
189 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000303709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0967  cotJC protein  38.78 
 
 
189 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000889969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0857  cotJC protein  38.78 
 
 
189 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0899  cotJC protein  38.78 
 
 
189 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.71221e-44 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2189  manganese containing catalase  37.75 
 
 
189 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0716  manganese containing catalase  38.27 
 
 
189 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000621736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1104  Catalase  41.62 
 
 
231 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000426374  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1016  catalase  39.9 
 
 
228 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00169796  unclonable  0.00000000343768 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2909  manganese containing catalase  37.44 
 
 
190 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0232  Catalase  37.32 
 
 
200 aa  136  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010197  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1213  manganese containing catalase  37.75 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.645424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0440  Catalase  37.75 
 
 
189 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1600  Catalase  31.34 
 
 
316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0517  Catalase  33.17 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1680  Catalase  33.17 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0606  catalase  34.58 
 
 
297 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0886  catalase  36.41 
 
 
302 aa  125  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2836  Catalase  30.88 
 
 
284 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0774925 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5807  Catalase  33.98 
 
 
275 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12571  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5296  Catalase  36.02 
 
 
287 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0565655  normal  0.201236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23050  manganese containing catalase  34.38 
 
 
193 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1876  manganese containing catalase  29.17 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3979  catalase  34.17 
 
 
274 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819277  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0815  Catalase  35.48 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.683068  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0221  Catalase  33.46 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20670  Mn-containing catalase  31.78 
 
 
289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1848  Catalase  32.22 
 
 
301 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  0.135263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2898  Catalase  33.06 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.808431  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2075  catalase  31 
 
 
285 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0934  spore coat peptide assembly protein CotJC  33.5 
 
 
188 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0072871  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6390  catalase  33.61 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1068  spore coat protein CotJC  33.5 
 
 
188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00620626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2775  catalase  31.44 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3002  Catalase  31.44 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0705397  normal  0.0852902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1821  catalase  32.99 
 
 
295 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.47568  normal  0.0328704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1877  Catalase  30.96 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1447  manganese containing catalase  30.13 
 
 
270 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1481  manganese containing catalase  33.51 
 
 
184 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000413774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11980  Mn-containing catalase  31.22 
 
 
321 aa  95.5  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0681  manganese containing catalase  33.67 
 
 
297 aa  85.9  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2914  catalase, Mn-containing  29.36 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3134  catalase, Mn-containing  29.36 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2123  catalase, Mn-containing  28.9 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3134  catalase, Mn-containing  28.9 
 
 
284 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2839  manganese containing catalase  28.9 
 
 
287 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2882  Mn-containing catalase  28.44 
 
 
308 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0729  manganese containing catalase  29.21 
 
 
298 aa  79  0.00000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000123231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1316  Catalase  29.52 
 
 
294 aa  79  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1142  manganese containing catalase  29.21 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0584316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0952  Catalase  28.92 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684232  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5727  manganese containing catalase  26.12 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.388852  hitchhiker  0.00719162 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5945  manganese containing catalase  28.22 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995052  normal  0.0254671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4741  manganese containing catalase  24.9 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819531 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>