More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1858 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1446  aldehyde dehydrogenase  70.59 
 
 
465 aa  665    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  0.248948 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1858  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
459 aa  943    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0838083 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10478  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  59.87 
 
 
473 aa  598  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128776  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1911  aldehyde dehydrogenase  56.73 
 
 
458 aa  551  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03968  succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.97 
 
 
462 aa  541  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  46.27 
 
 
460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1292  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+]  46.58 
 
 
458 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  45.37 
 
 
465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2399  Aldehyde Dehydrogenase  45.51 
 
 
460 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  44.62 
 
 
466 aa  423  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0330  aldehyde dehydrogenase family protein  43.33 
 
 
457 aa  424  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0316513  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2056  Aldehyde Dehydrogenase  43.98 
 
 
457 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  44.08 
 
 
457 aa  418  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1858  Aldehyde Dehydrogenase  44.2 
 
 
457 aa  420  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0388  Aldehyde Dehydrogenase_  44.64 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000227501  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2070  aldehyde dehydrogenase  44.84 
 
 
475 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0905776  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  43.61 
 
 
466 aa  415  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  44.08 
 
 
465 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0352  aldehyde dehydrogenase family protein  42.67 
 
 
457 aa  403  1e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000509141  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1989  aldehyde dehydrogenase family protein  43.9 
 
 
462 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344108  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1074  putative aldehyde dehydrogenase  42.38 
 
 
454 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000640606  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2737  Aldehyde Dehydrogenase  45.15 
 
 
454 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1926  aldehyde dehydrogenase  44.84 
 
 
455 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.515635  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1541  hypothetical protein  41.45 
 
 
462 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1442  hypothetical protein  41.67 
 
 
462 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  41.91 
 
 
454 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1346  Aldehyde Dehydrogenase  42.6 
 
 
454 aa  395  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.211595  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  41.25 
 
 
464 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00454  aldehyde-dehydrogenase like protein YneI  42.26 
 
 
454 aa  379  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  40.97 
 
 
452 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3534  aldehyde dehydrogenase  43.17 
 
 
455 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.46589 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4209  Aldehyde Dehydrogenase  42.73 
 
 
455 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4169  Aldehyde Dehydrogenase  42.73 
 
 
455 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1120  aldehyde dehydrogenase  41.81 
 
 
485 aa  378  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000801479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0839  aldehyde Dehydrogenase  41.76 
 
 
455 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  41.69 
 
 
452 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0377  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.67 
 
 
454 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3003  aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 
469 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000280927  normal  0.841466 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4244  aldehyde dehydrogenase  43.46 
 
 
452 aa  373  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0803768  normal  0.0353537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1825  Aldehyde Dehydrogenase  40.94 
 
 
461 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2400  Aldehyde Dehydrogenase  44.49 
 
 
463 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2453  Aldehyde Dehydrogenase  42.11 
 
 
455 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  41.27 
 
 
456 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1956  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.88 
 
 
457 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  43.36 
 
 
456 aa  363  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1725  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
471 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450617  decreased coverage  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4408  Aldehyde Dehydrogenase  41.09 
 
 
457 aa  362  7.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2946  aldehyde dehydrogenase  40.75 
 
 
463 aa  362  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3617  Aldehyde Dehydrogenase  38.38 
 
 
470 aa  361  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3357  aldehyde dehydrogenase  40.75 
 
 
463 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01482  predicted aldehyde dehydrogenase  40.98 
 
 
462 aa  359  6e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2121  Aldehyde Dehydrogenase  40.98 
 
 
462 aa  359  6e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0323198  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4778  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  44.91 
 
 
456 aa  359  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01493  hypothetical protein  40.98 
 
 
462 aa  359  6e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0775  aldehyde dehydrogenase  41.19 
 
 
463 aa  359  7e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.442992  normal  0.410628 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2133  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  40.98 
 
 
462 aa  358  8e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.753  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1607  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  40.98 
 
 
462 aa  358  8e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.764255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1681  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
462 aa  358  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.956976  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1811  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.43 
 
 
462 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1742  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.14 
 
 
470 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1647  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  40.76 
 
 
462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1696  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.43 
 
 
462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.087576  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1637  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.43 
 
 
462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1646  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.2 
 
 
462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00984812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4194  Aldehyde Dehydrogenase  39.16 
 
 
487 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1629  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.43 
 
 
462 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1299  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.43 
 
 
470 aa  357  2.9999999999999997e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3151  aldehyde dehydrogenase family protein  39.02 
 
 
461 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4853  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.47 
 
 
456 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  38.8 
 
 
461 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15470  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.69 
 
 
458 aa  355  6.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.580059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2394  aldehyde dehydrogenase  40.53 
 
 
463 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0666523  normal  0.869122 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1725  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  40.53 
 
 
462 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.875923  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1971  aldehyde dehydrogenase  41.46 
 
 
460 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0984  aldehyde dehydrogenase  40.09 
 
 
463 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4876  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.47 
 
 
456 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2138  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  40.53 
 
 
462 aa  355  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.752498  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1006  Aldehyde Dehydrogenase  39.87 
 
 
463 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1018  aldehyde dehydrogenase  39.87 
 
 
463 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.752265  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3039  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  41.19 
 
 
477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  40.58 
 
 
526 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2005  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  41.87 
 
 
462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6093  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 
463 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2704  aldehyde dehydrogenase  38.58 
 
 
461 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.598513 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 
456 aa  353  4e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.25 
 
 
456 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2542  aldehyde dehydrogenase  40.97 
 
 
454 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.17 
 
 
455 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9222  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 
463 aa  352  8.999999999999999e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2488  succinic-semialdehyde dehydrogenase, putative  40.53 
 
 
463 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101295  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2660  aldehyde dehydrogenase family protein  39.87 
 
 
463 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349181  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10236  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.44 
 
 
511 aa  351  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  44.03 
 
 
456 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2318  Aldehyde Dehydrogenase  38.82 
 
 
452 aa  350  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170105  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1706  Aldehyde Dehydrogenase  41.63 
 
 
463 aa  349  5e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.588412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  40.18 
 
 
452 aa  349  6e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  38.19 
 
 
457 aa  348  9e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2563  aldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 
461 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1626  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
463 aa  348  1e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.411023  normal  0.0128015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3122  Aldehyde Dehydrogenase_  39.52 
 
 
469 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>