More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0705 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_0705  ribosomal protein S19  100 
 
 
91 aa  186  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000939134  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0851  SSU ribosomal protein S19P  73.63 
 
 
92 aa  143  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000892272  hitchhiker  0.0000772184 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3324  30S ribosomal protein S19  81.4 
 
 
93 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000239735 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  79.07 
 
 
93 aa  142  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0937  30S ribosomal protein S19  81.4 
 
 
93 aa  142  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000587656  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1350  30S ribosomal protein S19  74.44 
 
 
92 aa  141  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.760122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  70 
 
 
93 aa  140  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  77.91 
 
 
93 aa  140  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  70 
 
 
94 aa  140  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  70 
 
 
90 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  71.43 
 
 
94 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  72.22 
 
 
90 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  70 
 
 
92 aa  137  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  68.48 
 
 
93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1071  30S ribosomal protein S19  75.58 
 
 
93 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000120025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  71.59 
 
 
89 aa  135  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0193  hypothetical protein  70.33 
 
 
91 aa  135  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.305188 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  67.39 
 
 
93 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1674  SSU ribosomal protein S19P  71.43 
 
 
92 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1044  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
93 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
95 aa  134  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1017  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
93 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1034  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
93 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702423  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1791  SSU ribosomal protein S19P  68.13 
 
 
92 aa  134  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.219827  normal  0.0847276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  68.13 
 
 
91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5045  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
93 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0166823  normal  0.166411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1937  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
98 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1942  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
98 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2022  30S ribosomal protein S19  69.77 
 
 
98 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  65.22 
 
 
93 aa  133  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1309  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
93 aa  133  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.415086  normal  0.102263 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2684  30S ribosomal protein S19  67.03 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2740  ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.148901  normal  0.251541 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1761  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120416  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1281  ribosomal protein S19  70.45 
 
 
87 aa  131  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  65.56 
 
 
90 aa  131  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  131  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
92 aa  131  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
91 aa  131  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1915  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0670  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 
92 aa  130  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122055  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0702  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 
92 aa  130  6e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  72.09 
 
 
95 aa  130  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  69.32 
 
 
88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1125  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  62.64 
 
 
93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19991  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.380662  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  68.48 
 
 
92 aa  129  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3901  SSU ribosomal protein S19P  63.04 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  65.93 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  65.22 
 
 
94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  62.64 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  61.54 
 
 
91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
92 aa  128  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17361  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  63.74 
 
 
93 aa  128  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1253  30S ribosomal protein S19  69.57 
 
 
92 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0795171  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  60.87 
 
 
93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1942  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16741  30S ribosomal protein S19  63.74 
 
 
91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1683  ribosomal protein S19  64.84 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000325115  hitchhiker  0.0000106177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3991  ribosomal protein S19  70.65 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1959  30S ribosomal protein S19  64.84 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  63.74 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  69.23 
 
 
89 aa  127  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 
93 aa  127  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2655  ribosomal protein S19  65.22 
 
 
93 aa  127  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
92 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
92 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  62.64 
 
 
92 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>