27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1514 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1514  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  649  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  4.01583e-11 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1337  hypothetical protein  30.93 
 
 
335 aa  125  8e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  28.57 
 
 
278 aa  96.3  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  26.74 
 
 
257 aa  73.9  3e-12  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1031  hypothetical protein  31.47 
 
 
183 aa  62.8  8e-09  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.413291  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0739  hypothetical protein  39.39 
 
 
194 aa  61.6  2e-08  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  4.4038e-06 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2329  conserved hypothetical protein  28.28 
 
 
227 aa  59.7  7e-08  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.000461934  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1297  hypothetical protein  35.57 
 
 
166 aa  57.4  4e-07  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0937853 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1021  hypothetical protein  24.31 
 
 
277 aa  56.2  7e-07  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3500  hypothetical protein  24.73 
 
 
199 aa  55.1  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1208  hypothetical protein  40.68 
 
 
148 aa  51.2  2e-05  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544976  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1484  hypothetical protein  44 
 
 
148 aa  51.2  2e-05  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2616  hypothetical protein  25.56 
 
 
188 aa  50.4  4e-05  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145924  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1817  hypothetical protein  26.82 
 
 
231 aa  50.4  4e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.820651  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1153  hypothetical protein  44.07 
 
 
95 aa  50.8  4e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.301811  normal  0.0575588 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf523  RmuC domain protein  20.85 
 
 
453 aa  49.7  7e-05  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1215  hypothetical protein  34.43 
 
 
154 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.13658  normal  0.0940233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2053  hypothetical protein  25.21 
 
 
479 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000533469 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2025  paREP5  25.5 
 
 
177 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  23.36 
 
 
1874 aa  46.2  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  22.83 
 
 
229 aa  44.3  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0946  hypothetical protein  36.62 
 
 
82 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1355  hypothetical protein  21.76 
 
 
239 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3854  hypothetical protein  22.4 
 
 
218 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3903  hypothetical protein  22.4 
 
 
218 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1303  hypothetical protein  29.17 
 
 
297 aa  42.4  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0531274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1240  hypothetical protein  30.23 
 
 
185 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>