11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2025 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2025  paREP5  100 
 
 
177 aa  347  5e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  34.31 
 
 
278 aa  146  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1297  hypothetical protein  38.07 
 
 
166 aa  105  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0937853 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0739  hypothetical protein  36.9 
 
 
194 aa  102  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000044038 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  36.97 
 
 
257 aa  86.3  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1023  hypothetical protein  57.14 
 
 
67 aa  70.9  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44913  normal  0.64465 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1337  hypothetical protein  39.73 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0461  hypothetical protein  55.1 
 
 
64 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0946  hypothetical protein  57.5 
 
 
82 aa  52.4  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0935  paREP5ab  28.85 
 
 
188 aa  45.1  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000129322  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1514  hypothetical protein  35.94 
 
 
334 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000401583 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>