9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0935 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0935  paREP5ab  100 
 
 
188 aa  371  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000129322  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0571  paREP5ab  66.67 
 
 
97 aa  138  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0570  paREP5a  42.4 
 
 
127 aa  92  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1437  hypothetical protein  33.91 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0808147  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  34.55 
 
 
257 aa  55.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  28.08 
 
 
278 aa  56.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1297  hypothetical protein  28.57 
 
 
166 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0937853 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0739  hypothetical protein  32 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000044038 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2025  paREP5  28.85 
 
 
177 aa  44.7  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>