11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0570 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0570  paREP5a  100 
 
 
127 aa  250  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0935  paREP5ab  42.4 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000129322  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  28.72 
 
 
257 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  25.51 
 
 
278 aa  47  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3796  putative Bdr protein  34.94 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3848  hypothetical protein  34.94 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  36 
 
 
177 aa  43.9  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  26.05 
 
 
1235 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2365  hypothetical protein  37.33 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  27.59 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  30.68 
 
 
178 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>