More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0838 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0456  butyryl-CoA dehydrogenase  90.73 
 
 
410 aa  774    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.820933  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1436  butyryl-CoA dehydrogenase  91.95 
 
 
410 aa  788    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.170652  hitchhiker  0.00553945 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0838  butyryl-CoA dehydrogenase  100 
 
 
410 aa  840    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0539  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  69.9 
 
 
405 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00283131 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0400  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.82 
 
 
402 aa  448  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0677  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.54 
 
 
400 aa  420  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.270118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0276  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.92 
 
 
398 aa  360  3e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0872822 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0575  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.91 
 
 
398 aa  333  2e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  44.21 
 
 
379 aa  322  8e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.79 
 
 
380 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.46 
 
 
381 aa  317  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2068  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.8 
 
 
385 aa  317  3e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.89 
 
 
642 aa  316  5e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.26 
 
 
379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.47 
 
 
379 aa  312  7.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.26 
 
 
380 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  43.68 
 
 
379 aa  310  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0919  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.53 
 
 
383 aa  309  5e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.43 
 
 
380 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  43.68 
 
 
379 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.95 
 
 
379 aa  306  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  43.68 
 
 
379 aa  306  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.57 
 
 
379 aa  306  3e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1058  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40 
 
 
386 aa  307  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.405365  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.93 
 
 
376 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.37 
 
 
380 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  43.42 
 
 
379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.24 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  42.11 
 
 
379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  43.42 
 
 
379 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  43.42 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  43.16 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  43.42 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  43.16 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  43.42 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3108  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.8 
 
 
383 aa  302  6.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.6 
 
 
394 aa  302  7.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3040  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.16 
 
 
402 aa  302  9e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0629704  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1318  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.48 
 
 
384 aa  301  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0793911 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  43.68 
 
 
379 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  43.68 
 
 
379 aa  301  1e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28760  acyl-CoA dehydrogenase  40.9 
 
 
382 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.0971486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.48 
 
 
387 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.72 
 
 
386 aa  300  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.15 
 
 
389 aa  299  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.21 
 
 
379 aa  299  6e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  42.37 
 
 
380 aa  298  1e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0736  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  42.19 
 
 
379 aa  298  1e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.763418 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.08 
 
 
379 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  38.26 
 
 
387 aa  297  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.94 
 
 
390 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.94 
 
 
390 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  42.22 
 
 
379 aa  296  4e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.11 
 
 
379 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4353  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.26 
 
 
385 aa  296  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2355  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.74 
 
 
381 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.774843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2163  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.29 
 
 
389 aa  296  5e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.820192  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3822  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.6 
 
 
379 aa  296  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.962066  normal  0.565208 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  45.5 
 
 
389 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2548  acyl-CoA dehydrogenase  42.22 
 
 
381 aa  293  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2285  acyl-CoA dehydrogenase  42.22 
 
 
381 aa  293  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2812  acyl-CoA dehydrogenase  42.22 
 
 
381 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1715  Acyl-CoA dehydrogenase-like  40.37 
 
 
379 aa  293  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1802  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.48 
 
 
381 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2603  acyl-CoA dehydrogenase  42.22 
 
 
381 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.608519  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2511  acyl-CoA dehydrogenase  42.22 
 
 
381 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.84 
 
 
379 aa  293  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2369  acyl-CoA dehydrogenase  42.22 
 
 
381 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.73982  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0714  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.42 
 
 
388 aa  293  5e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.0860013 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  44.18 
 
 
376 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  44.18 
 
 
376 aa  292  8e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  44.18 
 
 
376 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  44.18 
 
 
376 aa  291  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  44.18 
 
 
381 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  41.15 
 
 
380 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1526  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.02 
 
 
404 aa  291  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.84855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  44.18 
 
 
381 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2547  acyl-CoA dehydrogenase  41.95 
 
 
381 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4743  butyryl-CoA dehydrogenase  39.05 
 
 
417 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.37 
 
 
379 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0762  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.71 
 
 
381 aa  291  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  0.783766 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.83 
 
 
376 aa  290  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.84 
 
 
379 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2327  acyl-CoA dehydrogenase  41.95 
 
 
381 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2560  acyl-CoA dehydrogenase  41.95 
 
 
381 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.1486499999999994e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  43.92 
 
 
376 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  43.92 
 
 
381 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  43.92 
 
 
376 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  41.84 
 
 
379 aa  289  7e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  39.84 
 
 
379 aa  289  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.11 
 
 
381 aa  289  8e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2382  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.05 
 
 
389 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1327  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.97 
 
 
399 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  38.79 
 
 
389 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0268  butyryl-CoA dehydrogenase  40.68 
 
 
379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.36 
 
 
379 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0934  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.05 
 
 
387 aa  286  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.496704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2369  acyl-CoA dehydrogenase-like  41.16 
 
 
380 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1345  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  38.69 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0155  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.73 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000954759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>