236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2102 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2102  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
194 aa  400  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0909168  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 
189 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150578  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3232  acetyltransferase  37.65 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  43.83 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2463  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0279306  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6272  hypothetical protein  40.74 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72260  hypothetical protein  40.74 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  38.92 
 
 
895 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  37.41 
 
 
900 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2710  GCN5-related N-acetyltransferase  37.2 
 
 
175 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297237  hitchhiker  0.000129512 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3164  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
812 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  34.59 
 
 
897 aa  98.6  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  32.7 
 
 
911 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 
182 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.298594  normal  0.469762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 
182 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.712566  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3289  acetyltransferase  28.32 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.252345  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  30.95 
 
 
918 aa  89.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  32.35 
 
 
905 aa  89  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
810 aa  88.6  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00627705 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
898 aa  88.2  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  35.03 
 
 
892 aa  87  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.33 
 
 
892 aa  87.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  33.97 
 
 
915 aa  86.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3848  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 
192 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000121275  normal  0.760581 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3962  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 
192 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00434349  normal  0.0285152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
889 aa  85.1  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 
898 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3997  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0143681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  30.77 
 
 
911 aa  82  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
891 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.680583  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0975  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.021927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1501  CoA-binding domain protein  32.39 
 
 
886 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137638  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1436  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.068223 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
897 aa  78.2  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
908 aa  78.2  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
901 aa  78.2  0.00000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4289  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
807 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
888 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05540  hypothetical protein  31.58 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00436113  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1663  acetyltransferase, GNAT family  30.41 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146581  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  29.03 
 
 
877 aa  75.9  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  31.72 
 
 
920 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2207  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
904 aa  74.7  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
892 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1477  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
896 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1237  acetyltransferase  30.71 
 
 
1024 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000574609  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  28.39 
 
 
877 aa  74.7  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1554  acetyltransferase  30.71 
 
 
803 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00991343  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1742  acetyltransferase  30.71 
 
 
803 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00130768  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2999  acetyltransferase  30.71 
 
 
803 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000057298  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2882  acetyltransferase  30.71 
 
 
803 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0367  acetyltransferase  30.71 
 
 
787 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00347204  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
882 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2967  GNAT family acetyltransferase  30 
 
 
809 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
846 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0316376 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0404  acetyltransferase  30.71 
 
 
787 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.121441  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  30.64 
 
 
893 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2206  acetyltransferase  29.29 
 
 
836 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0254612  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6923  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
834 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.297711 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
896 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
882 aa  72.8  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
893 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1772  GCN5-related N-acetyltransferase  28.88 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0639273  normal  0.595385 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5525  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
806 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  28.57 
 
 
892 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1904  CoA-binding  31.58 
 
 
915 aa  71.2  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5336  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
785 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3083  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.458832  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02478  fused predicted acyl-CoA synthetase: NAD(P)-binding subunit/ATP-binding subunit  29.66 
 
 
886 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
886 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2128  hypothetical protein  29.52 
 
 
907 aa  70.5  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02442  hypothetical protein  29.66 
 
 
886 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2952  acetyltransferase, GNAT family protein  29.66 
 
 
886 aa  70.9  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487518  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1093  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
886 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312736  normal  0.038329 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2737  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  29.66 
 
 
886 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1293  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2871  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  29.66 
 
 
886 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3821  acetyltransferase, GNAT family protein  29.66 
 
 
886 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126569  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2741  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  29.66 
 
 
886 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.225885  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0051  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0134  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
785 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  29.03 
 
 
921 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5396  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
785 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.916817  normal  0.647823 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
895 aa  70.1  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
887 aa  69.7  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  28.92 
 
 
976 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4747  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
785 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  27.46 
 
 
882 aa  68.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
893 aa  68.9  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
900 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4815  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.342854  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1570  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3564  CoA-binding domain protein  35.29 
 
 
902 aa  68.2  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.695831  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5238  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
900 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4771  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
900 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  28.87 
 
 
886 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  28.87 
 
 
886 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  28.87 
 
 
886 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>