231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1186 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1186  flavodoxin  100 
 
 		 150 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1024  flavodoxin  88 
 
 		 150 aa  248  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0897  flavodoxin  73.83 
 
 		 151 aa  226  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0813  flavodoxin  73.79 
 
 		 151 aa  224  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4628  flavodoxin  76.22 
 
 		 151 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4488  flavodoxin  76.22 
 
 		 151 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4612  flavodoxin  74.83 
 
 		 151 aa  217  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1692  flavodoxin  70.47 
 
 		 150 aa  204  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19660  flavodoxin  69.8 
 
 		 150 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.16255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3283  flavodoxin  68.28 
 
 		 149 aa  191  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3588  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.89 
 
 		 148 aa  114  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3170  flavodoxin  40.54 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0898  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.28 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4053  flavodoxin  40.28 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3082  flavodoxin  40.28 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256992  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02635  flavodoxin  40.28 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02597  hypothetical protein  40.28 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.917177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0922  flavodoxin  40.28 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2934  flavodoxin  40.28 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2930  flavodoxin  40.28 
 
 		 149 aa  103  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03036  flavodoxin  40 
 
 		 149 aa  103  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.230795  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3094  flavodoxin  39.58 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.448879  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0936  flavodoxin  42.66 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000373319  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2986  flavodoxin  38.78 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3168  flavodoxin  38.78 
 
 		 154 aa  99.4  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3243  flavodoxin  38.19 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.207571 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3365  flavodoxin  40.41 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.294622  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1547  flavodoxin  37.5 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3285  flavodoxin  38.19 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.339839  normal  0.738816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3288  flavodoxin  37.16 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2823  flavodoxin  41.89 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3186  flavodoxin  38.19 
 
 		 149 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.551035 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3123  flavodoxin  37.5 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.941554 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2649  flavodoxin  41.22 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2716  flavodoxin  41.22 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3105  flavodoxin  37.5 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2909  flavodoxin  40.54 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.129799  normal  0.479147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1443  flavodoxin  40.54 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1474  flavodoxin  40.54 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3170  flavodoxin  36.81 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660936  normal  0.0886101 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00434  flavodoxin  37.16 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2642  flavodoxin  41.38 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.66337  normal  0.959919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1438  flavodoxin  40.54 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1622  flavodoxin  38.46 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1061  flavodoxin  36.11 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.238271  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3440  flavodoxin  36.11 
 
 		 149 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002018  flavoprotein MioC  36.49 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00370796  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2890  flavodoxin  36.81 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1008  flavodoxin  36.11 
 
 		 149 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1341  flavodoxin  39.19 
 
 		 154 aa  90.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3795  flavodoxin  36.81 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00043068 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1806  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.24 
 
 		 153 aa  90.1  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2516  flavodoxin  35.37 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000882543  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1132  flavodoxin  37.5 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3183  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.58 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.26856  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1263  flavodoxin  36.49 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.644769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3857  flavodoxin  36.24 
 
 		 146 aa  87  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000243053 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4183  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.55 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.130901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3983  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.54 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4907  flavodoxin  37.67 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204961  hitchhiker  0.000475727 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1473  YbhB and YbcL  37.06 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4537  flavodoxin  37.41 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.186367  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4252  flavodoxin  35.14 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4247  flavodoxin  36.73 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3764  flavodoxin  37.25 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.188706  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4498  flavodoxin  33.56 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000121939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4029  flavodoxin  35.1 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04097  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.13 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0001  flavodoxin  35.57 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.337726  hitchhiker  0.000580002 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4267  flavodoxin  34.72 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.714863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1706  flavodoxin  33.33 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1908  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.9 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.938438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4910  flavodoxin  34.9 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.157282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4102  flavodoxin  34.03 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3937  flavodoxin  34.44 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104179 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0003  flavodoxin  35.33 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.664218  hitchhiker  0.0000119397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4057  flavodoxin  35.62 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0001  flavodoxin  31.94 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0001  flavodoxin  36 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3742  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.51 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.329047  normal  0.152842 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4208  flavodoxin  34.03 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0487556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4519  flavodoxin  32.41 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.480433  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4377  flavodoxin  32.41 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0171898  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4122  flavodoxin  33.57 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000640858  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3903  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.84 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4158  flavodoxin  34.03 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4323  flavodoxin  32.41 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.413593  hitchhiker  0.0000000000612205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4087  flavodoxin  33.33 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0440879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2982  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.82 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00353782  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4252  flavodoxin  31.94 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.199089  normal  0.0328126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03626  flavodoxin  31.94 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0352208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0001  flavodoxin  34.48 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.285908  normal  0.657203 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03570  hypothetical protein  31.94 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0642242  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0001  flavodoxin  34.48 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000145912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3958  flavodoxin  31.94 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00491665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5178  flavodoxin  31.94 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000182988  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4216  flavodoxin  34.48 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000001981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4378  flavodoxin  31.72 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000023992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4225  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.94 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.215216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4179  flavodoxin  31.94 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0115076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>