More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1507 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  97.77 
 
 		 224 aa  443  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  97.32 
 
 		 224 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  91.44 
 
 		 224 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  79.73 
 
 		 224 aa  362  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  77.93 
 
 		 224 aa  358  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  76.58 
 
 		 224 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  77.58 
 
 		 227 aa  350  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  75 
 
 		 226 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  72.77 
 
 		 226 aa  329  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39270  Peptidase M22, glycoprotease  72.07 
 
 		 225 aa  305  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  53.1 
 
 		 233 aa  221  9e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  54.42 
 
 		 233 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  54.78 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  52.65 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  50.45 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  50.45 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  50.45 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  50.66 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  50.66 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  50.66 
 
 		 232 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  50 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  50 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  49.12 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2231  peptidase M22, glycoprotease  49.12 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391268  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  49.11 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  51.8 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  49.11 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  48.66 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  48.66 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  48.23 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  48.66 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  47.01 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  48.66 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  48.66 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  48.21 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  48.21 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  47.58 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  48.66 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  46.19 
 
 		 236 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  48.03 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  46.19 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  47.56 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  46.19 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  43.69 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  46.93 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  46.22 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  44.39 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  44.69 
 
 		 234 aa  180  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  49.77 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  49.53 
 
 		 266 aa  178  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  43.69 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  46.61 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  46.61 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000381298  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  43.24 
 
 		 237 aa  175  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  43.24 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  43.24 
 
 		 237 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  46.85 
 
 		 239 aa  174  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  44.93 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  44.83 
 
 		 239 aa  172  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  43.53 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  43.5 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  44.83 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  42.41 
 
 		 232 aa  168  5e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  42.92 
 
 		 238 aa  167  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1731  peptidase M22, glycoprotease  46.82 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.978366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  39.91 
 
 		 239 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  45.05 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  40 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  40 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  42.86 
 
 		 236 aa  161  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  38.57 
 
 		 239 aa  161  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1193  peptidase M22, glycoprotease  46.88 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  41.41 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0994  peptidase M22 glycoprotease  40.6 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  39.56 
 
 		 223 aa  144  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  42.48 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  38.22 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  37.61 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1654  peptidase M22, glycoprotease  39.75 
 
 		 267 aa  139  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786528  decreased coverage  0.00849888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  42.79 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1365  peptidase M22 glycoprotease  40 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.988544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  42.15 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2483  peptidase M22 glycoprotease  40.68 
 
 		 276 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.318654  hitchhiker  0.00075041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1939  peptidase M22, glycoprotease  41.84 
 
 		 282 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1395  peptidase M22, glycoprotease  39.91 
 
 		 281 aa  131  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.834993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2210  hypothetical protein  44.39 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3940  peptidase M22, glycoprotease  41.26 
 
 		 236 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1981  peptidase M22, glycoprotease  42.27 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.637689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  39.57 
 
 		 246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1232  peptidase M22 glycoprotease  40.43 
 
 		 255 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal  0.181812 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2001  glycoprotease family protein  38.66 
 
 		 252 aa  124  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.274689  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1268  peptidase M22, glycoprotease  37.27 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6032  peptidase M22, glycoprotease  40.87 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.827723  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2045  peptidase M22, glycoprotease  40.87 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0976  peptidase M22 glycoprotease  41.26 
 
 		 283 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2146  peptidase M22 glycoprotease  40.09 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.472287  hitchhiker  0.00199457 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2516  hypothetical protein  40.09 
 
 		 222 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2064  peptidase M22 glycoprotease  40.87 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2610  glycoprotease family protein  38.02 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>