15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_21147 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_21147  predicted protein  100 
 
 		 307 aa  640    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08796  small monomeric GTPase (Gtr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09650)  44.16 
 
 		 332 aa  269  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07810  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.074189  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35930  predicted protein  44.16 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.345241  normal  0.0596635 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00953  small monomeric GTPase (Gtr2), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16500)  28.5 
 
 		 363 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.197724 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30449  predicted protein  29.38 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.903908  normal  0.469416 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14103  predicted protein  26.86 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.552614  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56609  predicted protein  29.93 
 
 		 185 aa  50.8  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.158476  normal  0.886863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  26.05 
 
 		 748 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  25 
 
 		 1015 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00630  hypothetical protein  21.31 
 
 		 262 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  26.05 
 
 		 1041 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0179  tRNA modification GTPase TrmE  24.11 
 
 		 464 aa  43.5  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38412  predicted protein  27.27 
 
 		 184 aa  42.7  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  22.73 
 
 		 1107 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>