12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_35930 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_35930  predicted protein  100 
 
 
334 aa  681    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.345241  normal  0.0596635 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21147  predicted protein  44.16 
 
 
307 aa  270  4e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08796  small monomeric GTPase (Gtr1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09650)  44.44 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07810  conserved hypothetical protein  43.28 
 
 
379 aa  245  6e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.074189  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30449  predicted protein  29.2 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.903908  normal  0.469416 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00953  small monomeric GTPase (Gtr2), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16500)  26.13 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.197724 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14103  predicted protein  24.39 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.552614  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  23.02 
 
 
937 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  23.02 
 
 
937 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51169  predicted protein  27.86 
 
 
213 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  25.66 
 
 
1015 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00630  hypothetical protein  23.02 
 
 
262 aa  42.4  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>