More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56599 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 814 aa  654    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 807 aa  759    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 819 aa  757    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 813 aa  662    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 824 aa  670    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  53.02 
 
 		 802 aa  879    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 807 aa  804    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 		 858 aa  830    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 804 aa  875    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 824 aa  679    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 949 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 802 aa  881    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 806 aa  786    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 969 aa  668    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 833 aa  813    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 831 aa  649    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 856 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 952 aa  681    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 802 aa  879    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 802 aa  880    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 801 aa  749    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 802 aa  879    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 859 aa  646    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 802 aa  869    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  100 
 
 		 899 aa  1866    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 857 aa  850    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 815 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 824 aa  699    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 		 857 aa  795    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 823 aa  697    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 827 aa  673    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 872 aa  648    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 802 aa  879    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 934 aa  675    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 824 aa  684    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 828 aa  665    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000102477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 		 805 aa  814    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 827 aa  673    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  49.94 
 
 		 805 aa  805    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 1016 aa  651    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 824 aa  677    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 829 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 958 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 802 aa  879    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 805 aa  857    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 819 aa  680    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 865 aa  652    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 838 aa  641    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 804 aa  753    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 813 aa  667    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 829 aa  701    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 806 aa  843    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 800 aa  713    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 806 aa  757    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 858 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 949 aa  678    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 824 aa  686    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 810 aa  708    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3454  leucyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 814 aa  683    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  49.83 
 
 		 835 aa  826    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 805 aa  801    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 971 aa  701    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 805 aa  857    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 802 aa  879    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 816 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 826 aa  688    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 819 aa  671    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 971 aa  701    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 817 aa  665    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13370  Leucyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 830 aa  675    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000131776  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 816 aa  683    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 816 aa  697    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 856 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 802 aa  881    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 829 aa  650    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1254  leucyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 817 aa  704    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.702652  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 840 aa  803    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 825 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 824 aa  705    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 954 aa  685    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  49.44 
 
 		 879 aa  815    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 829 aa  788    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 829 aa  834    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 		 804 aa  840    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 808 aa  860    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 833 aa  816    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 824 aa  679    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 801 aa  770    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 802 aa  877    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 805 aa  890    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 806 aa  815    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 823 aa  675    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 816 aa  781    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 828 aa  682    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 838 aa  805    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 971 aa  701    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 804 aa  776    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 968 aa  686    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 826 aa  668    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 829 aa  663    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>