13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49849 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_49849  predicted protein  100 
 
 
469 aa  953    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.725945  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_4234  predicted protein  49.83 
 
 
286 aa  246  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0191281  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29042  predicted protein  35.37 
 
 
385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192459  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15438  DMT family transporter: UDP-galactose  30.36 
 
 
325 aa  91.3  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0306391  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_51835  DMT family transporter: UDP-N-acetylglucosamine  27.3 
 
 
340 aa  86.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.230907  hitchhiker  0.00000272124 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33748  DMT family transporter: UDP-N-acetylglucosamine  27.21 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.248456  hitchhiker  0.00153598 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20120  predicted protein  27.48 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22739  predicted protein  25.62 
 
 
396 aa  53.5  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30615  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10676  UDP-galactose transporter (Eurofung)  23.75 
 
 
450 aa  53.5  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.552099 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22921  predicted protein  25.83 
 
 
337 aa  52  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.858448  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04830  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 
801 aa  50.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.269217  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50402  DMT family transporter: CMP-sialic acid/UDP-N-acetylglucosamine  25.44 
 
 
296 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.328391  normal  0.317384 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46194  predicted protein  23.58 
 
 
399 aa  47  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.792848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>