More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41002 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_41002  predicted protein  100 
 
 
475 aa  980    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86172  predicted protein  37.73 
 
 
417 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116821  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54676  Ubiquitin--protein ligase molybdopterin-converting factor  31.53 
 
 
437 aa  200  5e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00830  mitochondrion protein, putative  35.68 
 
 
474 aa  189  7e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.671697  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04714  ThiF domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08610)  34.62 
 
 
515 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2278  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.74 
 
 
244 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00531511  hitchhiker  0.000000738809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.58 
 
 
253 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000172262  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3133  ThiF family protein  37.62 
 
 
268 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.852277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3199  ThiF family protein  37.62 
 
 
268 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.24 
 
 
254 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.43 
 
 
244 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3213  ThiF family protein  37.14 
 
 
268 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3313  ThiF family protein  37.14 
 
 
268 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.223246  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3150  ThiF family protein  37.14 
 
 
268 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2953  ThiF family protein  36.79 
 
 
266 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0973303  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02663  hypothetical protein  36.79 
 
 
268 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0876  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.79 
 
 
268 aa  117  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3118  ThiF family protein  36.79 
 
 
268 aa  117  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00141325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02624  hypothetical protein  36.79 
 
 
268 aa  117  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2956  ThiF family protein  36.79 
 
 
268 aa  117  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0900  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.79 
 
 
268 aa  117  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4459  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.73 
 
 
259 aa  117  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000135994 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3058  ThiF family protein  36.87 
 
 
268 aa  116  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0969752  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0073  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.76 
 
 
264 aa  116  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000480961  normal  0.411412 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  33.62 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1368  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.34 
 
 
255 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000273518  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0852  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.53 
 
 
261 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2998  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.23 
 
 
275 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1062  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.73 
 
 
341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.5 
 
 
263 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  36.93 
 
 
269 aa  114  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0761  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.71 
 
 
246 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000178365  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.97 
 
 
242 aa  114  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.3 
 
 
242 aa  113  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  36.36 
 
 
269 aa  113  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4077  ThiF family protein  36.32 
 
 
266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  34.45 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.16 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1048  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.51 
 
 
275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3224  hypothetical protein  38.51 
 
 
275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  normal  0.551633 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
300 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0996  thiF family protein  38.51 
 
 
275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0511396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3809  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.43 
 
 
268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000533838  hitchhiker  0.000000527658 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.41 
 
 
258 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.59 
 
 
242 aa  111  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1255  hypothetical protein  33.71 
 
 
255 aa  111  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000298288  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  31.53 
 
 
272 aa  110  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1525  ThiF family protein  35.02 
 
 
276 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.87 
 
 
258 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0546  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.66 
 
 
277 aa  110  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0491251  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0360  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.13 
 
 
288 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00356091  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0660  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.13 
 
 
288 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0996044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.64 
 
 
255 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3381  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.71 
 
 
272 aa  110  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2495  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.13 
 
 
288 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0905  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.13 
 
 
288 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.386795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0108  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.13 
 
 
288 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00087346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3182  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.08 
 
 
277 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2486  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.5 
 
 
285 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.184998 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0902  HesA/MoeB/ThiF family protein  37.13 
 
 
288 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2615  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.5 
 
 
285 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0923  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.93 
 
 
270 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.145938  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0515  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.65 
 
 
286 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.7 
 
 
256 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.06 
 
 
285 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0718  HesA/MoeB/ThiF family protein  35.11 
 
 
288 aa  107  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0036619  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0818  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.76 
 
 
295 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412635  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0251  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.39 
 
 
265 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  31.58 
 
 
249 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0550  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.7 
 
 
254 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.43 
 
 
257 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5899  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.5 
 
 
285 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1956  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.22 
 
 
285 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3958  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2567  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.22 
 
 
285 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450041  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.47 
 
 
253 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594436  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0542  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.52 
 
 
264 aa  104  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2591  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.06 
 
 
285 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0791  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.41 
 
 
246 aa  103  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0742  ThiF family protein  35.15 
 
 
285 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.441652  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3220  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.08 
 
 
285 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4248  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.02 
 
 
255 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000534198  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2571  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.42 
 
 
243 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  0.0248599 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.11 
 
 
255 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  35.19 
 
 
255 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0715  hesA/moeB/thiF family protein  32.56 
 
 
255 aa  101  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000990791  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3305  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.83 
 
 
274 aa  101  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0512  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.66 
 
 
268 aa  101  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3117  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.29 
 
 
255 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000496284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.6 
 
 
254 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.17 
 
 
254 aa  100  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  34.39 
 
 
252 aa  100  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1681  HesA/MoeB/ThiF family protein  30.89 
 
 
296 aa  99  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.19 
 
 
258 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0619  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.84 
 
 
244 aa  98.2  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.19184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.25 
 
 
262 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.333296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4197  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.96 
 
 
269 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.489561  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1527  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.86 
 
 
271 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0678963  normal  0.117289 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4534  hesA/moeB/thiF family protein  32.09 
 
 
255 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4521  hesA/moeB/thiF family protein  32.09 
 
 
255 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000182259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>