15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_34681 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_34681  predicted protein  100 
 
 		 329 aa  664    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0414055  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01860  conserved hypothetical protein  25.4 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0285542  normal  0.653902 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50236  predicted protein  24.5 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.370457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.545731 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02570  mitochondrion protein, putative  24.23 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0237  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.44 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.36 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.667307 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0187  UDP-galactose 4-epimerase  29.47 
 
 		 344 aa  46.6  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.611091  decreased coverage  0.00729822 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  31.46 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0087  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase protein  30.39 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5138  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.67 
 
 		 459 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0107  UDP-galactose 4-epimerase  29 
 
 		 343 aa  43.1  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3156  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  23.66 
 
 		 361 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0215  UDP-glucose 4-epimerase  29.47 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1513  steroid dehydrogenase  23.55 
 
 		 365 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>