More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0625 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 193 aa  402  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  66.3 
 
 		 210 aa  270  9e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  68.78 
 
 		 195 aa  269  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  64.29 
 
 		 220 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  65.03 
 
 		 199 aa  256  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  65.03 
 
 		 219 aa  251  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  65.95 
 
 		 223 aa  249  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  65.75 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  69.36 
 
 		 218 aa  248  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  66.85 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  65.12 
 
 		 199 aa  245  3e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  63.59 
 
 		 219 aa  244  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  65.57 
 
 		 216 aa  243  9e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  62.03 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  60.99 
 
 		 186 aa  231  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  60.33 
 
 		 187 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  60.44 
 
 		 186 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  60.33 
 
 		 187 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  60.56 
 
 		 186 aa  229  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  61.99 
 
 		 239 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  61.99 
 
 		 239 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  62.57 
 
 		 235 aa  228  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 235 aa  227  1e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  62.07 
 
 		 213 aa  224  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  56.67 
 
 		 186 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  57.69 
 
 		 186 aa  223  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  56.67 
 
 		 186 aa  222  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 		 181 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 		 181 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  56.67 
 
 		 186 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  55.85 
 
 		 243 aa  221  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 		 185 aa  220  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  57.87 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  56.77 
 
 		 235 aa  219  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  51.89 
 
 		 194 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 		 189 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  57.87 
 
 		 181 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  57.87 
 
 		 181 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  56.73 
 
 		 193 aa  218  5e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  55 
 
 		 190 aa  218  5e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  60.48 
 
 		 216 aa  218  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 		 181 aa  217  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 		 181 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  59.88 
 
 		 213 aa  215  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  58.68 
 
 		 179 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  55.23 
 
 		 195 aa  214  8e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  53.93 
 
 		 198 aa  214  9e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  57.65 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  55.81 
 
 		 190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 		 181 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  58.68 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  56.4 
 
 		 190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  56.52 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  55.06 
 
 		 184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  52.78 
 
 		 184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  55.81 
 
 		 190 aa  211  5.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  56.14 
 
 		 186 aa  211  5.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  54.49 
 
 		 179 aa  209  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  58.08 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  53.18 
 
 		 190 aa  208  4e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  53.44 
 
 		 270 aa  207  6e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  52.27 
 
 		 190 aa  207  6e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  54.75 
 
 		 185 aa  207  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 		 182 aa  204  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  53.59 
 
 		 224 aa  204  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  51.69 
 
 		 180 aa  201  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  52.81 
 
 		 214 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  52.81 
 
 		 214 aa  201  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 		 200 aa  201  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  54.91 
 
 		 226 aa  199  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  54.44 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 		 181 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 188 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08188  hypothetical protein similar to GTP cyclohydrolase I (Broad)  53.65 
 
 		 329 aa  198  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  52.6 
 
 		 213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  53.8 
 
 		 435 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 181 aa  198  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  52.6 
 
 		 213 aa  198  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  55.06 
 
 		 181 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  55.06 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  52.43 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  54.34 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  51.63 
 
 		 257 aa  193  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  51.72 
 
 		 203 aa  192  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  54.24 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  51.96 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  54.19 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  51.67 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  51.46 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  53.63 
 
 		 194 aa  188  5e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  51.93 
 
 		 199 aa  188  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  51.67 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  51.09 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  48.96 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  49.19 
 
 		 220 aa  187  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  51.89 
 
 		 194 aa  187  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>