187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4183 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_4183  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  100 
 
 
301 aa  620  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4467  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  93.02 
 
 
301 aa  578  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251848  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0924  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  57.88 
 
 
294 aa  362  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0628  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  51.55 
 
 
299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0589  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  51.19 
 
 
300 aa  289  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38220  hypothetical protein  47.46 
 
 
302 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3252  hypothetical protein  46.78 
 
 
302 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3789  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  46.39 
 
 
322 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2998  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  45.36 
 
 
298 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0124793  normal  0.0292007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1914  siderophore-interacting protein  42.57 
 
 
300 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.28 
 
 
308 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  38.14 
 
 
312 aa  192  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  37.02 
 
 
299 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1437  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.79 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3213  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.22 
 
 
325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000110595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3473  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.58 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100108  hitchhiker  0.00465132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3865  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.11 
 
 
311 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2292  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.16 
 
 
310 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636042  normal  0.986884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35080  siderophore-interacting protein  35.37 
 
 
345 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0424  Siderophore-interacting protein  34.63 
 
 
321 aa  163  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.625757 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1787  Siderophore-interacting protein  35.18 
 
 
325 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00316265  normal  0.123717 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04680  siderophore-interacting protein  31.95 
 
 
331 aa  149  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3931  siderophore-interacting protein  36.53 
 
 
346 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3731  Siderophore-interacting protein  34.04 
 
 
356 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  34.65 
 
 
276 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.15 
 
 
625 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  33.56 
 
 
247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  31.85 
 
 
284 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  33.11 
 
 
340 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4105  Siderophore-interacting protein  35.06 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779952  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.85 
 
 
257 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2932  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.81 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453632  hitchhiker  0.000505579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  30.03 
 
 
259 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3016  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.48 
 
 
275 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.46 
 
 
281 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0112  Siderophore-interacting protein  29.22 
 
 
277 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21440  siderophore-interacting protein  28.85 
 
 
277 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  0.530536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1601  Siderophore-interacting protein  28.86 
 
 
265 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.43 
 
 
283 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  28.82 
 
 
281 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  29.93 
 
 
270 aa  95.9  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.31 
 
 
271 aa  95.5  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  29.3 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  30.94 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  31.13 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  30.07 
 
 
289 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.81 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.22 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  30.69 
 
 
311 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0237  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.62 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  28.86 
 
 
255 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08230  siderophore-interacting protein  26.91 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.227116  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  29.82 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0773  siderophore-interacting protein  31.01 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71701  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  30.28 
 
 
348 aa  90.1  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  29.12 
 
 
617 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  28.57 
 
 
623 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.47 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  28.62 
 
 
275 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  25.75 
 
 
267 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.1 
 
 
296 aa  86.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  30.22 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3539  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.21 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  26.33 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.66 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  28.36 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.14 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  29.28 
 
 
304 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  27.24 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  27.24 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  27.24 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  27.24 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  27.24 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  27.24 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  27.24 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  27.65 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  30.1 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3395  vibriobactin utilization protein ViuB  28.42 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.472238 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  26.8 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  26.8 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  29.95 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  26.64 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  29.37 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  28.47 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22120  siderophore-interacting protein  29.19 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  27.53 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  26.99 
 
 
275 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.76 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  30.1 
 
 
253 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  26.85 
 
 
266 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3687  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.43 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.443256  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  27.3 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  26.35 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  27.08 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.23 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  26.98 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  27.24 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3561  Siderophore-interacting protein  27.4 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  27.69 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2919  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  26.07 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>