119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4131 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4131  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  340  5e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4412  protein of unknown function UPF0157  88.34 
 
 		 166 aa  262  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2507  protein of unknown function UPF0157  57.06 
 
 		 171 aa  194  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.309459  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2738  hypothetical protein  48.8 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0940497  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3138  hypothetical protein  48.43 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2758  hypothetical protein  49.69 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.459788  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0246  hypothetical protein  42.04 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.643536  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0069  hypothetical protein  45.57 
 
 		 319 aa  146  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3352  protein YqkA  41.4 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1708  hypothetical protein  43.48 
 
 		 192 aa  144  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1699  glutamate-rich protein  42.94 
 
 		 187 aa  142  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.492225  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1584  hypothetical protein  44.87 
 
 		 318 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0490  hypothetical protein  42.94 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000708419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4208  hypothetical protein  42.04 
 
 		 174 aa  141  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3929  hypothetical protein  43.95 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.283485  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1409  hypothetical protein  44.87 
 
 		 318 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1029  hypothetical protein  42.04 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3840  hypothetical protein  42.68 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4122  hypothetical protein  42.68 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502842 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4007  hypothetical protein  42.68 
 
 		 174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.298552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4320  hypothetical protein  42.68 
 
 		 174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4167  hypothetical protein  43.31 
 
 		 174 aa  137  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3854  hypothetical protein  42.68 
 
 		 174 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0669413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2797  hypothetical protein  41.4 
 
 		 174 aa  136  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4231  hypothetical protein  42.04 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0157  hypothetical protein  44.51 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2000  hypothetical protein  43.95 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0096  protein of unknown function UPF0157  45.71 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2831  hypothetical protein  38.89 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00971649  normal  0.206362 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1757  hypothetical protein  42.77 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.334844  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_184  hypothetical protein  40.24 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.682808  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0605  protein of unknown function UPF0157  39.35 
 
 		 185 aa  107  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1290  protein of unknown function UPF0157  38.32 
 
 		 375 aa  102  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2349  protein of unknown function UPF0157  35.29 
 
 		 220 aa  100  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2828  hypothetical protein  30.77 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117917  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2583  hypothetical protein  30.57 
 
 		 169 aa  94.7  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2788  hypothetical protein  30.13 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2807  hypothetical protein  30.13 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.062321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2591  hypothetical protein  30.13 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2542  hypothetical protein  29.94 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2508  hypothetical protein  29.94 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2779  hypothetical protein  30.13 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0119576  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3103  hypothetical protein  35.95 
 
 		 171 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0343219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2671  glutamate-rich protein GrpB  30.06 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.267173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2637  glutamate-rich protein GrpB  30.57 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000727014 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2494  hypothetical protein  33.14 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.021339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2809  protein of unknown function UPF0157  39.13 
 
 		 406 aa  90.9  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2428  hypothetical protein  30.12 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2505  hypothetical protein  28.93 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2663  hypothetical protein  30.12 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000853592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2465  hypothetical protein  30.12 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.884514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2646  hypothetical protein  30.12 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0204  protein of unknown function UPF0157  40.15 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1655  protein of unknown function UPF0157  39.51 
 
 		 191 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2389  hypothetical protein  30.72 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00719854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63380  hypothetical protein  34.59 
 
 		 242 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.903165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2714  hypothetical protein  30.12 
 
 		 170 aa  87.8  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2985  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0439608 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2673  hypothetical protein  29.56 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00128043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2849  hypothetical protein  30 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0276112  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0412  protein of unknown function UPF0157  32.93 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0920  hypothetical protein  36.76 
 
 		 169 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3224  hypothetical protein  28.66 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2708  hypothetical protein  33.99 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.95734  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  32.52 
 
 		 601 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3062  hypothetical protein  36.71 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4110  protein of unknown function UPF0157  33.73 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2784  glutamate-rich protein GrpB  31.62 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0346281 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1571  hypothetical protein  34.76 
 
 		 365 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.332111  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2729  protein of unknown function UPF0157  32.08 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2990  protein of unknown function UPF0157  32.24 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377938  normal  0.0790959 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0552  hypothetical protein  30 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1483  hypothetical protein  35.76 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2329  hypothetical protein  28.03 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  normal  0.089639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2751  protein of unknown function UPF0157  34 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12290  hypothetical protein  34.67 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3326  protein of unknown function UPF0157  31.85 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2072  protein of unknown function UPF0157  34.81 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25920  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  31.71 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02640  hypothetical protein  32.19 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.451354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3053  protein of unknown function UPF0157  32.73 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0759  protein of unknown function UPF0157  30.91 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02587  hypothetical protein  35.78 
 
 		 143 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5520  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  35.46 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0322  protein of unknown function UPF0157  28.3 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169012  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3353  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  31.4 
 
 		 402 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657332  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25790  hypothetical protein  30.38 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0641  protein of unknown function UPF0157  30.91 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000199394  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3533  hypothetical protein  24.7 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3559  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  31.4 
 
 		 410 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.470533 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3312  hypothetical protein  25.3 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.488113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3572  hypothetical protein  25.3 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3527  hypothetical protein  25.44 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4039  protein of unknown function UPF0157  35.76 
 
 		 191 aa  67.4  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2069  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  30.81 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00862257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3004  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32.43 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3050  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32.43 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1356  protein of unknown function UPF0157  28.24 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000276888  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4207  protein of unknown function UPF0157  32.48 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3764  dephospho-CoA kinase  35.1 
 
 		 395 aa  64.3  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0117276  normal  0.0914469 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>