35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72020 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_72020  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  894    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5679  hypothetical protein  68.81 
 
 
434 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6256  hypothetical protein  45.84 
 
 
497 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6257  putative glycosyltransferase  40.76 
 
 
484 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5680  hypothetical protein  50.22 
 
 
523 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72010  putative glycosyltransferase  49.04 
 
 
542 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3861  hypothetical protein  27.72 
 
 
583 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5051  Glycosyltransferase-like protein  28.63 
 
 
759 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172901  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7580  WbdA; mannosyl transferase A  28.43 
 
 
377 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207702  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 
401 aa  55.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 
3301 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  29.59 
 
 
373 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
791 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 
359 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
357 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  28.47 
 
 
1219 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
774 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  24.1 
 
 
1232 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 
679 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
1261 aa  46.6  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
366 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 
1233 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
838 aa  45.8  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 
856 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 
359 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 
392 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 
725 aa  44.3  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
1241 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 
381 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  31.07 
 
 
375 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
402 aa  43.5  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2254  glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 
358 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0765492  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
435 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>