34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_00221 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_00221  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  58.33 
 
 
76 aa  97.8  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  58.33 
 
 
75 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00181  hypothetical protein  53.62 
 
 
82 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.910571  normal  0.0515701 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00171  hypothetical protein  38.96 
 
 
79 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.46492  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1345  hypothetical protein  38.96 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  46.05 
 
 
85 aa  67.8  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  47.83 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  42.11 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  47.14 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00171  hypothetical protein  38.24 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00171  hypothetical protein  38.24 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.187807  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0018  hypothetical protein  39.71 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.722623  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00171  hypothetical protein  37.88 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  43.94 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  43.94 
 
 
79 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  42.42 
 
 
84 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  44.44 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  37.68 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  33.8 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  33.8 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  31.82 
 
 
796 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  42.59 
 
 
74 aa  47.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  36.76 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  38.33 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  44.44 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  44.44 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  26.92 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  40.38 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  37.74 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  43.75 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  42.59 
 
 
92 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  39.62 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  30.26 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>