41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0365 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0365  multitransmembrane protein  100 
 
 
258 aa  494  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0533  multitransmembrane protein  51.64 
 
 
258 aa  244  8e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0867  hypothetical protein  42.92 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0890076  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  42.54 
 
 
253 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0459  YibE/F family protein  41.07 
 
 
257 aa  159  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000110124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  29.84 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  26.89 
 
 
260 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  26.89 
 
 
260 aa  100  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  29.72 
 
 
373 aa  86.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  30.84 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  28.87 
 
 
370 aa  79.3  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  27.8 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  28.03 
 
 
396 aa  77  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  27.98 
 
 
404 aa  76.3  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  28.89 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  25.5 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  27.66 
 
 
434 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  28.57 
 
 
393 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  27.89 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  26.5 
 
 
428 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  28.12 
 
 
409 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  28.11 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  24.1 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  26.52 
 
 
451 aa  61.6  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  24.59 
 
 
436 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  27.01 
 
 
395 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  24.57 
 
 
446 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  27.9 
 
 
370 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  27.9 
 
 
370 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  25.21 
 
 
422 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  33.03 
 
 
370 aa  53.1  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  24.03 
 
 
397 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  31.9 
 
 
386 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  24.45 
 
 
427 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  24.38 
 
 
499 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  24.5 
 
 
396 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  24.79 
 
 
484 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0866  hypothetical protein  24.34 
 
 
372 aa  46.6  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  24.41 
 
 
361 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0364  multitransmembrane protein  27.35 
 
 
365 aa  42.4  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1824  multitransmembrane protein  26.87 
 
 
258 aa  42.4  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>