53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2311 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2311  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0159  hypothetical protein  50.22 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.673519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3846  hypothetical protein  51.53 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5833  hypothetical protein  48 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3384  hypothetical protein  44.92 
 
 		 266 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.739679 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3889  hypothetical protein  39.68 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.31119  normal  0.156158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  36.77 
 
 		 316 aa  121  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  37.81 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  38.28 
 
 		 298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  33.09 
 
 		 315 aa  109  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  38.07 
 
 		 317 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  35.19 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  31.12 
 
 		 300 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  33.91 
 
 		 322 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  32.52 
 
 		 300 aa  99  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  34.47 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  30.56 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  29.68 
 
 		 332 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  28.96 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4758  hypothetical protein  37.35 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.343516  normal  0.0425976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11200  membrane-like protein  40.28 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00435487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.8 
 
 		 309 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  31.05 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2794  hypothetical protein  36.57 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.132736  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3120  hypothetical protein  31.82 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  26.1 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.11 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2514  hypothetical protein  31.44 
 
 		 214 aa  52.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0855  hypothetical protein  31.44 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  24.56 
 
 		 327 aa  52  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  25.41 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  30.69 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  32.38 
 
 		 294 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  34.41 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  24.14 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  32.38 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  34.41 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  34.41 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  34.41 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  34.41 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  34.41 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  24.69 
 
 		 752 aa  44.3  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  34.41 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  32.26 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  32.26 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  34.41 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  32.26 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1032  membrane protein  32.26 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  32.26 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  32.26 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  26.48 
 
 		 651 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2443  membrane protein-like protein  26.45 
 
 		 287 aa  42.4  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2151  membrane protein  32.26 
 
 		 289 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>