More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0006 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  99.18 
 
 
176 aa  249  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  99.18 
 
 
176 aa  249  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  98.36 
 
 
176 aa  248  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  99.18 
 
 
157 aa  248  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  100 
 
 
122 aa  248  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  98.36 
 
 
176 aa  248  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  99.18 
 
 
122 aa  247  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  99.18 
 
 
122 aa  247  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  99.18 
 
 
122 aa  247  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  99.18 
 
 
122 aa  247  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  99.18 
 
 
122 aa  247  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  99.18 
 
 
122 aa  247  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  99.18 
 
 
122 aa  247  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  99.18 
 
 
122 aa  247  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  99.18 
 
 
122 aa  247  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  99.18 
 
 
122 aa  247  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1323  ISCc1, transposase OrfB  80 
 
 
101 aa  170  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1290  IS4 family transposase  98.67 
 
 
75 aa  156  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.34094 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2924  IS4 family transposase  98.67 
 
 
75 aa  156  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0215  IS4 family transposase  98.67 
 
 
75 aa  156  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  56.78 
 
 
177 aa  130  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  56.78 
 
 
177 aa  130  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  56.78 
 
 
177 aa  130  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  56.78 
 
 
177 aa  130  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  56.78 
 
 
177 aa  130  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  48.76 
 
 
253 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  51.64 
 
 
260 aa  117  4e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  48.76 
 
 
253 aa  117  5e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  48.76 
 
 
253 aa  117  5e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  48.76 
 
 
253 aa  117  5e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9114  transposase protein  48.76 
 
 
122 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  47.93 
 
 
253 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0548  hypothetical protein  47.93 
 
 
128 aa  112  2e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  47.5 
 
 
249 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  48.21 
 
 
113 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  48.21 
 
 
113 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  48.21 
 
 
113 aa  111  4e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  48.21 
 
 
113 aa  110  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  47.32 
 
 
113 aa  110  7e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  45.83 
 
 
249 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  46.67 
 
 
266 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  48.67 
 
 
255 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  47.5 
 
 
254 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  47.5 
 
 
254 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  47.5 
 
 
254 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  47.5 
 
 
254 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  47.5 
 
 
254 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  44.17 
 
 
164 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  46.28 
 
 
131 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  48.31 
 
 
135 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  46.28 
 
 
138 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  47.54 
 
 
129 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  47.54 
 
 
129 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  47.54 
 
 
129 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  47.54 
 
 
129 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  47.54 
 
 
129 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  47.54 
 
 
129 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  47.54 
 
 
129 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  43.33 
 
 
164 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  43.33 
 
 
164 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  43.33 
 
 
164 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  43.33 
 
 
164 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  47.54 
 
 
336 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  47.54 
 
 
190 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  46.67 
 
 
254 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  47.54 
 
 
190 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  47.54 
 
 
190 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  47.54 
 
 
190 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  47.54 
 
 
190 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  47.54 
 
 
190 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  47.54 
 
 
190 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  47.54 
 
 
190 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  47.54 
 
 
190 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  47.54 
 
 
190 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  47.54 
 
 
190 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  47.54 
 
 
190 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  46.67 
 
 
254 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  46.67 
 
 
254 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  46.67 
 
 
254 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  46.67 
 
 
254 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  46.67 
 
 
254 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0838  transposase OrfB  47.54 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.578121  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0327  transposase OrfB  47.54 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  42.28 
 
 
252 aa  99.4  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  42.28 
 
 
252 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0721  transposase OrfB  47.54 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0781  transposase OrfB  47.54 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  42.28 
 
 
252 aa  99.4  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1381  transposase OrfB  47.54 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.879769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0345  transposase OrfB  47.54 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.932854  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  42.28 
 
 
252 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  42.28 
 
 
252 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1932  transposase OrfB  47.54 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  42.28 
 
 
252 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  42.28 
 
 
252 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  42.28 
 
 
252 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0531  IS711, transposase orfB  47.54 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  44.74 
 
 
121 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  42.28 
 
 
252 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1037  transposase OrfB  47.54 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0972527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>