21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1317 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1317  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
95 aa  184  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00152206  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1971  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  37.63 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  33.73 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1237  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.371486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1484  protein of unknown function YGGT  31.25 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.514508  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  40.54 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  32.18 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09240  YGGT family  37.14 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00353139  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  40.26 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1890  protein of unknown function YGGT  31.91 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000126042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  33.73 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  34.18 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  31.03 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  35.16 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  41.82 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  31.03 
 
 
192 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  33.73 
 
 
187 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  32.14 
 
 
197 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0790  hythetical protein  37.14 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000412009  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  43.42 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>