16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3832 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3832  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00188009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2478  hypothetical protein  44.44 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  44.26 
 
 
505 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3697  hypothetical protein  44.44 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3770  hypothetical protein  44.44 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3710  hypothetical protein  44.44 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2588  hypothetical protein  44.29 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449874  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4176  hypothetical protein  37.5 
 
 
66 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165747  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1619  ferredoxin  49.18 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.466459  normal  0.186197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4428  oxidoreductase  45.9 
 
 
63 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0782655  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  36.07 
 
 
63 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0997  oxidoreductase  36.07 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.611298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2877  hypothetical protein  39.34 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  32.81 
 
 
69 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1479  putative ferredoxin  33.33 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.621705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1226  hypothetical protein  45 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>