20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0074 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0074  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  265  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0801  hypothetical protein  32.77 
 
 
140 aa  76.6  1e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.927116  normal  0.500188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3944  hypothetical protein  27.48 
 
 
144 aa  75.9  2e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4831  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  75.5  2e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0115  hypothetical protein  33.08 
 
 
149 aa  75.1  3e-13  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.351913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0120  hypothetical protein  33.08 
 
 
149 aa  74.7  4e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.100163 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4439  hypothetical protein  31.3 
 
 
140 aa  73.2  1e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130932  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0120  hypothetical protein  31.54 
 
 
149 aa  72.4  2e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0125  hypothetical protein  33.85 
 
 
121 aa  71.2  4e-12  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0125  hypothetical protein  32.82 
 
 
150 aa  70.9  5e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0121  hypothetical protein  32.58 
 
 
150 aa  71.2  5e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144748  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0120  hypothetical protein  32.82 
 
 
150 aa  70.9  6e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0124  hypothetical protein  32.82 
 
 
150 aa  70.9  6e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3749  hypothetical protein  31.3 
 
 
140 aa  70.5  8e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4234  hypothetical protein  32.06 
 
 
150 aa  67.8  4e-11  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4155  hypothetical protein  31.54 
 
 
140 aa  67  7e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0400  hypothetical protein  27.73 
 
 
162 aa  67  9e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0089  hypothetical protein  27.05 
 
 
140 aa  62  2e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0036  L-asparaginase  25.6 
 
 
157 aa  51.2  4e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2706  hypothetical protein  31.3 
 
 
163 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>