19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0125 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0125  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  249  7e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0115  hypothetical protein  87.6 
 
 		 149 aa  228  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.351913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0120  hypothetical protein  88.43 
 
 		 149 aa  228  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393548 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0120  hypothetical protein  86.78 
 
 		 149 aa  226  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.100163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0120  hypothetical protein  84.3 
 
 		 150 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0125  hypothetical protein  84.3 
 
 		 150 aa  224  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0124  hypothetical protein  84.3 
 
 		 150 aa  223  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4234  hypothetical protein  83.47 
 
 		 150 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0121  hypothetical protein  83.47 
 
 		 150 aa  220  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4831  hypothetical protein  77.69 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4155  hypothetical protein  75.21 
 
 		 140 aa  197  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3749  hypothetical protein  74.38 
 
 		 140 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4439  hypothetical protein  73.55 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0089  hypothetical protein  54.17 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0801  hypothetical protein  42.02 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.927116  normal  0.500188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3944  hypothetical protein  38.14 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0400  hypothetical protein  42.61 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0036  L-asparaginase  42.74 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0074  hypothetical protein  33.85 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>