19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3749 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3749  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  289  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135879 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4439  hypothetical protein  81.43 
 
 		 140 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4831  hypothetical protein  79.29 
 
 		 140 aa  238  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4155  hypothetical protein  81.43 
 
 		 140 aa  236  9e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0120  hypothetical protein  75.37 
 
 		 149 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393548 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0115  hypothetical protein  73.68 
 
 		 149 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.351913 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0124  hypothetical protein  72.73 
 
 		 150 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0120  hypothetical protein  72.73 
 
 		 150 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0120  hypothetical protein  72.93 
 
 		 149 aa  207  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.100163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4234  hypothetical protein  72.73 
 
 		 150 aa  207  5e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0125  hypothetical protein  71.97 
 
 		 150 aa  206  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0121  hypothetical protein  73.39 
 
 		 150 aa  197  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144748  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0125  hypothetical protein  74.38 
 
 		 121 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0089  hypothetical protein  52.17 
 
 		 140 aa  160  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0801  hypothetical protein  42.34 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.927116  normal  0.500188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3944  hypothetical protein  41.55 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0400  hypothetical protein  40.56 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0036  L-asparaginase  44.44 
 
 		 157 aa  96.7  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0074  hypothetical protein  31.3 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>