20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0089 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0089  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  288  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4155  hypothetical protein  55.71 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4831  hypothetical protein  51.43 
 
 		 140 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4439  hypothetical protein  50.71 
 
 		 140 aa  159  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3749  hypothetical protein  54.03 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0124  hypothetical protein  50.38 
 
 		 150 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0120  hypothetical protein  49.62 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0115  hypothetical protein  50.38 
 
 		 149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.351913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4234  hypothetical protein  49.62 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0125  hypothetical protein  48.87 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0120  hypothetical protein  50.38 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.100163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0120  hypothetical protein  50.38 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393548 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0121  hypothetical protein  52.46 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144748  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0125  hypothetical protein  54.17 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0801  hypothetical protein  38.57 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.927116  normal  0.500188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3944  hypothetical protein  37.06 
 
 		 144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0036  L-asparaginase  37.42 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0400  hypothetical protein  34.64 
 
 		 162 aa  93.6  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0074  hypothetical protein  27.05 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00326  L-asparaginase  24.82 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>