19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4439 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4439  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  290  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4831  hypothetical protein  82.14 
 
 		 140 aa  249  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4155  hypothetical protein  80 
 
 		 140 aa  236  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3749  hypothetical protein  81.43 
 
 		 140 aa  230  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0124  hypothetical protein  71.94 
 
 		 150 aa  219  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0115  hypothetical protein  74.07 
 
 		 149 aa  217  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.351913 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0120  hypothetical protein  71.22 
 
 		 150 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4234  hypothetical protein  71.22 
 
 		 150 aa  215  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0120  hypothetical protein  72.26 
 
 		 149 aa  215  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.100163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0125  hypothetical protein  70.5 
 
 		 150 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0120  hypothetical protein  71.53 
 
 		 149 aa  213  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393548 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0121  hypothetical protein  74.8 
 
 		 150 aa  201  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144748  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0125  hypothetical protein  73.55 
 
 		 121 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0089  hypothetical protein  50.71 
 
 		 140 aa  159  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0400  hypothetical protein  44.37 
 
 		 162 aa  113  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3944  hypothetical protein  42.45 
 
 		 144 aa  110  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0801  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.927116  normal  0.500188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0036  L-asparaginase  43.7 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0074  hypothetical protein  31.3 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>