19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0120 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0120  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  310  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393548 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0115  hypothetical protein  95.97 
 
 
149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.351913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0120  hypothetical protein  95.3 
 
 
149 aa  299  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.100163 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0120  hypothetical protein  84.67 
 
 
150 aa  263  8e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0124  hypothetical protein  84.67 
 
 
150 aa  262  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0125  hypothetical protein  84 
 
 
150 aa  261  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4234  hypothetical protein  84 
 
 
150 aa  259  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0121  hypothetical protein  82 
 
 
150 aa  246  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144748  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0125  hypothetical protein  88.43 
 
 
121 aa  228  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4831  hypothetical protein  74.45 
 
 
140 aa  220  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4155  hypothetical protein  74.45 
 
 
140 aa  217  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4439  hypothetical protein  71.53 
 
 
140 aa  213  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.130932  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3749  hypothetical protein  78.23 
 
 
140 aa  206  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0089  hypothetical protein  50.38 
 
 
140 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0801  hypothetical protein  42.14 
 
 
140 aa  113  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.927116  normal  0.500188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0400  hypothetical protein  40.56 
 
 
162 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3944  hypothetical protein  39.84 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0036  L-asparaginase  43.59 
 
 
157 aa  95.9  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0074  hypothetical protein  31.54 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>