17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_R0021 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_R0021  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00204065  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0058  tRNA-Lys  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0053  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.231894  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0031  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0007  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0034  tRNA-Lys  97.96 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.336319  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0073  tRNA-Lys  95.74 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0027  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0055  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0006  tRNA-Lys  88.71 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0040  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00746142 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0006  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.507736 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0047  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271132  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0090  tRNA-Lys  86.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.28119  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0035  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0005  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0004  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>