17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_R0031 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_R0053  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.231894  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0031  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0021  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00204065  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0058  tRNA-Lys  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0006  tRNA-Lys  95.16 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0040  tRNA-Lys  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00746142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0034  tRNA-Lys  91.84 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.336319  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0007  tRNA-Lys  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0090  tRNA-Lys  88.52 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.28119  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0073  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0047  tRNA-Lys  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271132  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0017  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0045  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  100 
 
 		 777 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0027  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0055  tRNA-Lys  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0038  tRNA-Cys  100 
 
 		 96 bp  44.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>