More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2045 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2045  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 241 aa  475  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7344  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1505  integral membrane protein TerC  83.82 
 
 		 241 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0874873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4147  hypothetical protein  80.25 
 
 		 241 aa  362  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.976198  normal  0.766522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2948  Integral membrane protein TerC  77.31 
 
 		 240 aa  352  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2631  integral membrane protein TerC  78.15 
 
 		 240 aa  339  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.124087  decreased coverage  0.0000345218 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3874  integral membrane protein TerC  59.83 
 
 		 253 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  53.97 
 
 		 239 aa  265  5e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  52.7 
 
 		 259 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  52.92 
 
 		 238 aa  260  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  53.16 
 
 		 253 aa  257  9e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  56.47 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.71 
 
 		 519 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  50.62 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.71 
 
 		 519 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  51.71 
 
 		 519 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  51.71 
 
 		 519 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  51.71 
 
 		 519 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  52.7 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  52.32 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 518 aa  251  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50 
 
 		 516 aa  251  9.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  50 
 
 		 518 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 518 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 518 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  50 
 
 		 518 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  55.98 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  55 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50 
 
 		 518 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50 
 
 		 518 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  51.26 
 
 		 250 aa  250  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  50 
 
 		 518 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  50 
 
 		 518 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  52.3 
 
 		 242 aa  249  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  49.38 
 
 		 249 aa  248  7e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  49.17 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  51.49 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  55.36 
 
 		 255 aa  245  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  52.89 
 
 		 259 aa  245  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  48.97 
 
 		 514 aa  245  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 250 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 250 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  49.79 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  53.01 
 
 		 264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  56.03 
 
 		 245 aa  241  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  52.08 
 
 		 253 aa  241  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 		 250 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 252 aa  241  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  55.27 
 
 		 241 aa  241  9e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  49.36 
 
 		 518 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  56.03 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  46.84 
 
 		 528 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  48.97 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  47.66 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  49.16 
 
 		 523 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  56.17 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  49.16 
 
 		 523 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  51.04 
 
 		 241 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  55.56 
 
 		 253 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  53.16 
 
 		 253 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  48.95 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  47.92 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  53.16 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  48.74 
 
 		 523 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2367  CBS domain-containing protein  51.28 
 
 		 514 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  48.74 
 
 		 523 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  53.59 
 
 		 295 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2463  integral membrane protein TerC  51.28 
 
 		 514 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  55.79 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1650  CBS domain-containing protein  51.28 
 
 		 522 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  48.74 
 
 		 518 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  48.76 
 
 		 249 aa  236  4e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  52.32 
 
 		 253 aa  234  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  48.94 
 
 		 251 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  46.41 
 
 		 577 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  53.11 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  49.58 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  51.06 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  48.56 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  47.5 
 
 		 249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_004310  BR1721  hypothetical protein  51.06 
 
 		 247 aa  231  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.73889  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  45.83 
 
 		 510 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  45.57 
 
 		 518 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  47.86 
 
 		 530 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3194  integral membrane protein TerC  49.17 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  48.54 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  45.99 
 
 		 527 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  52.32 
 
 		 245 aa  228  5e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  45.15 
 
 		 522 aa  228  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1984  Integral membrane protein TerC  50.21 
 
 		 517 aa  228  7e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3716  Integral membrane protein TerC  48.33 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  48.76 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  48.76 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  51.26 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0537  integral membrane protein TerC  48.72 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  47.7 
 
 		 238 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1927  Integral membrane protein TerC  48.51 
 
 		 518 aa  225  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  45.57 
 
 		 529 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2691  membrane protein, TerC family  50.21 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.607869  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4355  Integral membrane protein TerC  49.79 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>