20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3537 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3537  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  327  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000060722  hitchhiker  0.00289108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11373  lipoprotein lprD  34.69 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.282281 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1300  hypothetical protein  40.44 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.135235  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1975  Glucitol operon activator-like protein  57.45 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2363  putative lipoprotein  36.92 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.221035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4283  putative lipoprotein  35.92 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.309945  normal  0.30463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4024  hypothetical protein  35 
 
 		 125 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24660  hypothetical protein  32.19 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.64549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0283  hypothetical protein  32.74 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3956  hypothetical protein  31.97 
 
 		 132 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0019599  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4326  hypothetical protein  27.56 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.922278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5662  Glucitol operon activator-like protein  33.63 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1815  hypothetical protein  36.92 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000174188  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3826  putative lipoprotein  50 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.155317  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3914  putative lipoprotein  50 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3840  putative lipoprotein  50 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0692951  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3346  hypothetical protein  34.67 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3577  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  48.5  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0055  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.231759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0164  hypothetical protein  56.25 
 
 		 276 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.309928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>