58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3292 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3292  flavin-nucleotide-binding protein-like protein  100 
 
 		 143 aa  285  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000330862  normal  0.034856 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1545  hypothetical protein  48.91 
 
 		 179 aa  134  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0980761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4928  hypothetical protein  47.48 
 
 		 177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.52831  normal  0.121155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2951  hypothetical protein  41.09 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3627  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.44 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3622  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  40.44 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3695  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.44 
 
 		 147 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.164379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1885  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.62 
 
 		 155 aa  97.1  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00315064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3638  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40 
 
 		 154 aa  96.7  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4254  hypothetical protein  42.42 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2138  hypothetical protein  40.32 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0498  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  40 
 
 		 201 aa  94.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0499  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  40.15 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0633  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.39 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429345  normal  0.0292132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4105  hypothetical protein  39.85 
 
 		 135 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0929325  normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3506  hypothetical protein  37.78 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2134  hypothetical protein  39.34 
 
 		 185 aa  87  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00539509  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1800  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  40.65 
 
 		 142 aa  86.7  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.468979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0952  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  39.2 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1100  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.6 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1111  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.6 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1083  hypothetical protein  37.6 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00152048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2084  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  41.41 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000123288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1002  hypothetical protein  38.24 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45242  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0261  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.61 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00900094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  39.52 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000125188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6155  hypothetical protein  40 
 
 		 225 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  hitchhiker  0.000659717 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04380  predicted flavin-nucleotide-binding protein  37.41 
 
 		 174 aa  80.1  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0947  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.68 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.011553  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1183  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4684  hypothetical protein  36.23 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3033  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.68 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4808  hypothetical protein  36.88 
 
 		 223 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.463187 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09680  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  38.58 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.313838  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1961  hypothetical protein  43.08 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000972412  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5621  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0873  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2259  hypothetical protein  36.36 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185149  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0393  hypothetical protein  34.4 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.831448  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0384  hypothetical protein  34.4 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0163229  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0372  hypothetical protein  34.4 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3379  hypothetical protein  40.16 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4549  hypothetical protein  40.46 
 
 		 236 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3095  hypothetical protein  38.17 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.929414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0982  hypothetical protein  32.79 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4069  hypothetical protein  43.88 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3470  hypothetical protein  36.51 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.753379  normal  0.434423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0993  putative DNA-binding protein  32.84 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2051  hypothetical protein  33.08 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0320963  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0353  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding protein  32.28 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.934539  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10081  hypothetical protein  35.07 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.239804  normal  0.111783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4835  hypothetical protein  37.1 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13150  hypothetical protein  34.09 
 
 		 110 aa  57  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0999  hypothetical protein  42.16 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.225673  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2075  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000436269 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0471  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.57 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0514663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6100  hypothetical protein  41.94 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6269  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.71 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.341844  normal  0.0782266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>