52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0052 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0052  PilT protein domain protein  100 
 
 		 133 aa  262  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6313  PilT protein domain protein  50 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4577  PilT protein-like  50.39 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0313  PilT protein domain protein  46.51 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.179857 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12772  hypothetical protein  43.08 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3454  PilT domain-containing protein  46.62 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4797  PilT domain-containing protein  42.31 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10635  hypothetical protein  49.22 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000236971  normal  0.294663 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5432  PilT domain-containing protein  43.65 
 
 		 133 aa  99.4  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.373074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0221  PilT domain-containing protein  42.75 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8285  PilT protein domain protein  48.06 
 
 		 128 aa  97.1  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394847  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4717  PilT domain-containing protein  43.65 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4706  PilT domain-containing protein  45.38 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.2127  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4819  PilT domain-containing protein  40.31 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4476  PilT domain-containing protein  44.7 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.187501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4793  PilT domain-containing protein  43.88 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0079864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2603  PilT protein domain protein  43.85 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0526832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1344  PilT protein-like  49.21 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1171  PilT domain-containing protein  43.51 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4620  PilT protein domain protein  45.04 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3171  PilT domain-containing protein  43.08 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231716  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0705  PilT protein domain protein  40.94 
 
 		 113 aa  87  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274401  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12013  hypothetical protein  44.09 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0291  hypothetical protein  41.04 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02550  hypothetical protein  37.69 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0736  PilT domain-containing protein  42.64 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395482  normal  0.855639 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0633  PilT domain-containing protein  42.96 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1130  PilT domain-containing protein  56.32 
 
 		 133 aa  84  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0945  PilT domain-containing protein  39.69 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1871  PilT domain-containing protein  70.91 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.520995  normal  0.175197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1445  PilT protein-like  44.03 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22620  hypothetical protein  39.23 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0004  PilT domain-containing protein  44.63 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9882  hypothetical protein  35.46 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1379  PilT protein domain protein  41.86 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.293782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2424  PilT protein domain protein  42.96 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5554  PilT protein domain protein  39.86 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal  0.0291692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1406  PilT protein domain protein  40.15 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.116397 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3268  PilT domain-containing protein  37.88 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207381  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3511  PilT domain-containing protein  37.88 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.729818  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10620  hypothetical protein  42.86 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00795839  normal  0.407097 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5502  PilT protein-like protein  40.46 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.835237 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5903  PilT domain-containing protein  40.46 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4604  PilT domain-containing protein  35.21 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2859  PilT domain-containing protein  42.98 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.528221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4668  PilT domain-containing protein  47.31 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4432  hypothetical protein  44.83 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818322  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3708  PilT domain-containing protein  37.04 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0702  PilT protein domain protein  67.44 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3944  PilT protein  38.71 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00101332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4325  PilT protein-like  32.59 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.287543  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0983  PilT domain-containing protein  34.38 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>