36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0025 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0025  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  549  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2562  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.23 
 
 
310 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.21131  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1412  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.85 
 
 
304 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.565335  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0142  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.13 
 
 
301 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0442  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.33 
 
 
300 aa  49.3  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.893193 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2264  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.85 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13420  predicted metalloprotease  30.6 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00442634  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1142  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.23 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000282768  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2331  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.44 
 
 
295 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.88553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.15 
 
 
284 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.97 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  27.21 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.71 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  26.22 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1761  metalloprotease  24.66 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.451117  normal  0.0302656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4701  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  34 
 
 
304 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11530  predicted metalloprotease  25 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0775973  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  26.22 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0293  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.23 
 
 
316 aa  43.9  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.22 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0335  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.35 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.340384  hitchhiker  0.00139185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2920  hypothetical protein  31.4 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.36 
 
 
288 aa  43.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5419  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  23.91 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893358  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1265  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  25.37 
 
 
300 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.496917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  26.83 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1837  metalloprotease-like protein  32.54 
 
 
322 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358453  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  30.68 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  26.67 
 
 
297 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3141  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.44 
 
 
262 aa  42.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0686164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  21.84 
 
 
284 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3224  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  25.93 
 
 
307 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1702  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  21.95 
 
 
291 aa  42.4  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  27.44 
 
 
287 aa  42  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2333  hypothetical protein  25.67 
 
 
281 aa  42  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>