264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_16221 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_16221  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  100 
 
 
290 aa  603  1e-172  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0239928  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0778  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  98.28 
 
 
290 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0812  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.97 
 
 
296 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.211227  hitchhiker  0.00219501 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1561  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  83.79 
 
 
290 aa  517  1e-146  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.442148  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12601  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  84.27 
 
 
293 aa  511  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.879707  hitchhiker  0.00432496 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20541  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  80.77 
 
 
318 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.143369 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13351  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  76.22 
 
 
289 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2457  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.43 
 
 
292 aa  451  1e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  4.72181e-05  hitchhiker  2.90022e-10 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3426  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.33 
 
 
290 aa  452  1e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2690  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  73.33 
 
 
290 aa  452  1e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.641434 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13651  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.44 
 
 
268 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.229398  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  78.49 
 
 
270 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13561  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  77.36 
 
 
268 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.338754  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3659  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  72.18 
 
 
298 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.69 
 
 
296 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0922  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  70.98 
 
 
292 aa  437  1e-122  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  4.02813e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4336  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  71.33 
 
 
294 aa  440  1e-122  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3866  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.97 
 
 
294 aa  437  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.086859  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  68.51 
 
 
296 aa  425  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2473  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.03 
 
 
295 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.59349e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3048  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  65.03 
 
 
296 aa  406  1e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0314071  normal  0.0184819 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  64.69 
 
 
319 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0484  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.64 
 
 
295 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.411276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1516  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.59 
 
 
303 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.603304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1734  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.15 
 
 
291 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.424728  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2034  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.94 
 
 
294 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  1.6391e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2049  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.5 
 
 
309 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0290  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.85 
 
 
291 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00110  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.9 
 
 
318 aa  384  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0915  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.34 
 
 
292 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.89 
 
 
290 aa  385  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.49594e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.03 
 
 
315 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2056  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.73 
 
 
350 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.447026 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1588  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.12 
 
 
282 aa  387  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3534  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.05 
 
 
327 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0200192 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1207  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.98 
 
 
294 aa  385  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0202592  normal  0.156512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.07 
 
 
317 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1288  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.28 
 
 
312 aa  384  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.24 
 
 
289 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.54 
 
 
291 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.69 
 
 
315 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.24 
 
 
292 aa  381  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.54 
 
 
291 aa  381  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0870  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.41 
 
 
308 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1440  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.21 
 
 
321 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.198845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0014  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60 
 
 
315 aa  381  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12450  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.41 
 
 
282 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1687  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60 
 
 
290 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0323438 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0578  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.54 
 
 
292 aa  381  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2575  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  59.73 
 
 
314 aa  381  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000932417 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.39 
 
 
329 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.54 
 
 
292 aa  381  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.54 
 
 
291 aa  381  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.70309e-08  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1052  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.28 
 
 
297 aa  377  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1023  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.19 
 
 
291 aa  378  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.165229  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2050  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  60.96 
 
 
308 aa  378  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.19493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2115  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.51 
 
 
319 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.160845  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0080  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.66 
 
 
315 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352778  decreased coverage  8.95825e-12 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0527  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.59 
 
 
317 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0240153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4178  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.58 
 
 
314 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.436375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0039  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.62 
 
 
364 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0208  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.51 
 
 
319 aa  380  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1062  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  59.86 
 
 
301 aa  379  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3381  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.23 
 
 
318 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.899304 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0543  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.59 
 
 
317 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4744  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.58 
 
 
301 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3696  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.93 
 
 
325 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3256  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.99 
 
 
306 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0354  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.59 
 
 
308 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.34 
 
 
318 aa  374  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.31 
 
 
315 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.189656  hitchhiker  1.12208e-10 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1711  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.49 
 
 
300 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.271634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2446  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.49 
 
 
290 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0992  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.14 
 
 
289 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2580  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.84 
 
 
294 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1320  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  63.29 
 
 
299 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.797629  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2348  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60 
 
 
312 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0732  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.7 
 
 
286 aa  376  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2209  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.84 
 
 
294 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0077  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.31 
 
 
315 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000417626  normal  0.0864281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0216  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.63 
 
 
317 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0389393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.31 
 
 
315 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  3.78016e-07 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1220  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.27 
 
 
304 aa  376  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  61.86 
 
 
317 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.569318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2162  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.93 
 
 
328 aa  371  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676955  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0268  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.55 
 
 
304 aa  371  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.43665  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0788  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  59.44 
 
 
290 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0493212  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0443  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.23 
 
 
308 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0692449  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0162  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.52 
 
 
303 aa  371  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0708  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.09 
 
 
286 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0184  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  59.17 
 
 
315 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0010  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.86 
 
 
317 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000663268  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0372  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.69 
 
 
314 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00009  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.52 
 
 
301 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0740  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  62.32 
 
 
328 aa  373  1e-102  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.786171  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0012  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.52 
 
 
335 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4203  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.23 
 
 
301 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4038  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.52 
 
 
303 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.300559 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1863  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.28 
 
 
294 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.48 
 
 
304 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>